More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3212 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  726    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  76.5 
 
 		 389 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  67.92 
 
 		 386 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  67.92 
 
 		 386 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  67.92 
 
 		 386 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  65.04 
 
 		 373 aa  475  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  66.12 
 
 		 366 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  66.58 
 
 		 385 aa  472  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  63.69 
 
 		 374 aa  472  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  64.38 
 
 		 368 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  63.34 
 
 		 373 aa  454  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  67.4 
 
 		 380 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  61.32 
 
 		 398 aa  441  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  60.92 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  63.64 
 
 		 385 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  60.48 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  58.54 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  63.89 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  62.06 
 
 		 368 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  58.11 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  48.76 
 
 		 425 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  51.42 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  53.37 
 
 		 385 aa  323  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  44.89 
 
 		 367 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  48.34 
 
 		 357 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  48.93 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  47.75 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  59.02 
 
 		 266 aa  269  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  52.94 
 
 		 483 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  43.32 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  42.37 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  44.86 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  42.42 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  40.83 
 
 		 421 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  38.26 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  39.55 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  42.28 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  40.12 
 
 		 342 aa  203  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  37.79 
 
 		 323 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  37.61 
 
 		 329 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  36.73 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  36.49 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  36.41 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  35.81 
 
 		 340 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  35.73 
 
 		 340 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  38.36 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  35.94 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  35.57 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.68 
 
 		 248 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  36.39 
 
 		 345 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.38 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  41.6 
 
 		 240 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  41.35 
 
 		 244 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  33.52 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  35.26 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.8 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  35.8 
 
 		 453 aa  169  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  35.61 
 
 		 331 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  36.54 
 
 		 342 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  36.16 
 
 		 341 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  36.16 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  36.16 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.51 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  36.16 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  36.16 
 
 		 341 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  35.23 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  35.23 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  35.8 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  35.23 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  34.19 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  34.19 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  35.61 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  35.31 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  28.61 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  35.57 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  31.83 
 
 		 372 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  36.04 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  32.79 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  32.39 
 
 		 326 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  34.11 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  33.05 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  30.79 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  32.66 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  32.68 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  30.73 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  34.53 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  29.6 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  31.39 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  35.1 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  33.42 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  33.53 
 
 		 323 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  29.02 
 
 		 386 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  30.75 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  33.8 
 
 		 343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  34.46 
 
 		 329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  33.7 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.82 
 
 		 353 aa  146  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  46.41 
 
 		 225 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  31.53 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.023428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>