More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0200 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  726    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  44.77 
 
 
366 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  45.11 
 
 
381 aa  245  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  43.32 
 
 
368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  43.39 
 
 
385 aa  242  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  40.89 
 
 
425 aa  242  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  43.5 
 
 
385 aa  236  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  41.33 
 
 
373 aa  235  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  40.33 
 
 
374 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  42.22 
 
 
386 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  42.22 
 
 
386 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  42.22 
 
 
386 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  40.58 
 
 
386 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  40.16 
 
 
397 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  40.88 
 
 
373 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  43.57 
 
 
368 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  38.12 
 
 
385 aa  213  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  41.13 
 
 
390 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  42.31 
 
 
363 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  39.55 
 
 
369 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  41.07 
 
 
370 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  38.07 
 
 
398 aa  202  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  39.57 
 
 
372 aa  200  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  42.42 
 
 
380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  33.51 
 
 
367 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  39.47 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  38.59 
 
 
372 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  35.54 
 
 
357 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  37.38 
 
 
433 aa  189  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  37.05 
 
 
421 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  36.49 
 
 
356 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  37.03 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  50.81 
 
 
483 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  34.04 
 
 
316 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  35.68 
 
 
389 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  34.45 
 
 
306 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  33.73 
 
 
388 aa  152  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  34.15 
 
 
306 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.06 
 
 
266 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  32.42 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  34.25 
 
 
323 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  33.74 
 
 
340 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  33.61 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  32.53 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  35.24 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  32.05 
 
 
342 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  31.51 
 
 
356 aa  132  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  33.24 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  30.95 
 
 
331 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  34.94 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  30.95 
 
 
346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  34.83 
 
 
360 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  40 
 
 
225 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  30.63 
 
 
340 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.71 
 
 
250 aa  123  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  30.84 
 
 
345 aa  123  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  31.71 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  27.55 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  29.53 
 
 
340 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  29.3 
 
 
372 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  31.78 
 
 
339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  30.75 
 
 
364 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  30.59 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  31.2 
 
 
338 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  30.9 
 
 
343 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  30.9 
 
 
343 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  32.55 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  32.01 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  31.49 
 
 
337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  32.84 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  30.32 
 
 
340 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  32.33 
 
 
315 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  30.29 
 
 
341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  28.49 
 
 
372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  29.73 
 
 
340 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  31.12 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  30.45 
 
 
453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  32.17 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.58 
 
 
228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  25.53 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.1 
 
 
230 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  28.25 
 
 
354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  31.74 
 
 
323 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  28.26 
 
 
376 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  31.55 
 
 
339 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  30.5 
 
 
325 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  31.33 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  37.82 
 
 
230 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  31.74 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  29.13 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  28.57 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.21 
 
 
243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  28.61 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  40.72 
 
 
228 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.19 
 
 
234 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  30.82 
 
 
357 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  27.18 
 
 
386 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  31.83 
 
 
323 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.98 
 
 
240 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>