More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3102 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  99.41 
 
 
341 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  97.07 
 
 
342 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  96.77 
 
 
341 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  97.07 
 
 
341 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  96.77 
 
 
341 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  96.77 
 
 
341 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  87.1 
 
 
453 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  86.22 
 
 
341 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  85.92 
 
 
341 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  86.22 
 
 
339 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  85.5 
 
 
338 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  85.71 
 
 
343 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  85.71 
 
 
343 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  82.4 
 
 
340 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  82.11 
 
 
340 aa  567  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  83.78 
 
 
342 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  86.12 
 
 
315 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  79.06 
 
 
340 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  76.95 
 
 
345 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  79.47 
 
 
343 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  79.47 
 
 
343 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  79.77 
 
 
343 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  64.94 
 
 
357 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  59.62 
 
 
337 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  58.79 
 
 
331 aa  362  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  56.63 
 
 
356 aa  362  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  53.7 
 
 
326 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  58.5 
 
 
312 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  54.11 
 
 
333 aa  345  6e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  56.01 
 
 
329 aa  345  6e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  57.1 
 
 
334 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  51.1 
 
 
319 aa  342  5.999999999999999e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  55.33 
 
 
340 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  54.3 
 
 
339 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  54 
 
 
364 aa  339  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  53.46 
 
 
325 aa  337  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  54.44 
 
 
337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  52.69 
 
 
387 aa  323  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  55.86 
 
 
342 aa  322  7e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  54.43 
 
 
340 aa  318  7.999999999999999e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  52.01 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  51.71 
 
 
360 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  47.67 
 
 
334 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  43.18 
 
 
316 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  39.87 
 
 
342 aa  218  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  39.87 
 
 
323 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  39.06 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  38.63 
 
 
322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  37.15 
 
 
323 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  42.53 
 
 
306 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  38.86 
 
 
376 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  38.12 
 
 
323 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  38.01 
 
 
322 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  42.21 
 
 
306 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  37.46 
 
 
323 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  37.46 
 
 
323 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  37.65 
 
 
323 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  36.96 
 
 
323 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  36.22 
 
 
323 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  38.41 
 
 
323 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  40.39 
 
 
313 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  34.97 
 
 
329 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  35.84 
 
 
350 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  36.34 
 
 
323 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  36.86 
 
 
320 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  34.01 
 
 
388 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  37.66 
 
 
318 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  36.66 
 
 
329 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0083  hypothetical protein  66.91 
 
 
221 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  35.15 
 
 
340 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  38.6 
 
 
366 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  34.12 
 
 
356 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  36.71 
 
 
390 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  35.66 
 
 
385 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  32.19 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  36.58 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  36.26 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  35.19 
 
 
369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  35.07 
 
 
373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  35.86 
 
 
368 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  34.31 
 
 
386 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  35.49 
 
 
386 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  35.49 
 
 
386 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  34.93 
 
 
386 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  32.96 
 
 
372 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  33.98 
 
 
397 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  36.5 
 
 
363 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  36.34 
 
 
389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  36.24 
 
 
385 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  41.38 
 
 
225 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  32.79 
 
 
374 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  32.75 
 
 
372 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  34.69 
 
 
375 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  33.98 
 
 
370 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  33.24 
 
 
398 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  43.48 
 
 
176 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  33.43 
 
 
381 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  45.34 
 
 
228 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.46 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>