More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3973 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  781    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  71.61 
 
 
386 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  71.61 
 
 
386 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  71.36 
 
 
386 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  71.21 
 
 
385 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  69.57 
 
 
374 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  70.51 
 
 
373 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  67.61 
 
 
373 aa  511  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  68.89 
 
 
397 aa  510  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  69.45 
 
 
380 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  62.94 
 
 
390 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  65.73 
 
 
366 aa  477  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  67.95 
 
 
368 aa  465  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  65.26 
 
 
363 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  62.98 
 
 
368 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  64.12 
 
 
385 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  61.32 
 
 
369 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  64.65 
 
 
389 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  60.15 
 
 
372 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  56.42 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  53.99 
 
 
372 aa  350  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  50.23 
 
 
425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  53.94 
 
 
385 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  49.87 
 
 
357 aa  323  3e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  50.51 
 
 
381 aa  319  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  40.46 
 
 
367 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  47.26 
 
 
370 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  46.02 
 
 
421 aa  272  9e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  54.76 
 
 
483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  41.99 
 
 
375 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  51.22 
 
 
266 aa  236  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  41.07 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  45.48 
 
 
402 aa  231  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  39.68 
 
 
356 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  42.64 
 
 
360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  38.58 
 
 
369 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  55.03 
 
 
433 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  38.81 
 
 
323 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  38.48 
 
 
329 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  36.66 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  34.93 
 
 
388 aa  169  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  34.24 
 
 
340 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  31.43 
 
 
340 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  31.95 
 
 
340 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  35.28 
 
 
323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.5 
 
 
240 aa  155  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.02 
 
 
244 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  32.15 
 
 
372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  34.39 
 
 
356 aa  153  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.78 
 
 
248 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  34.75 
 
 
323 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  32.37 
 
 
340 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.06 
 
 
353 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  31.84 
 
 
345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  33.33 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  33.33 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  29.25 
 
 
386 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  33.33 
 
 
338 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  33.08 
 
 
339 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  33.33 
 
 
453 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  48.82 
 
 
338 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  30.77 
 
 
346 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  34.55 
 
 
370 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  44.09 
 
 
225 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  33.69 
 
 
315 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  34.09 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  33.84 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  34.09 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  33.84 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  33.59 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  33.59 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  31.17 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  33.59 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  29.97 
 
 
398 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  33.59 
 
 
341 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  30.89 
 
 
372 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  33.08 
 
 
341 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  32.08 
 
 
376 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  30.05 
 
 
385 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  31.78 
 
 
389 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  33.24 
 
 
340 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  30.83 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  27.71 
 
 
379 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  34.2 
 
 
395 aa  136  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  31.48 
 
 
329 aa  136  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  28.69 
 
 
400 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  32.36 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  32.35 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  44.32 
 
 
242 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  32.21 
 
 
334 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  32.1 
 
 
323 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  32.54 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  40.31 
 
 
250 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  32.08 
 
 
326 aa  130  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  32.14 
 
 
362 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  31.54 
 
 
364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  46.75 
 
 
228 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  31.77 
 
 
329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  42.05 
 
 
233 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>