More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0628 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  62.06 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  57 
 
 		 340 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  59.86 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  56.66 
 
 		 340 aa  350  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  59.86 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  59.52 
 
 		 338 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  59.52 
 
 		 341 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  59.86 
 
 		 315 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  59.52 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  55.63 
 
 		 345 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  60.75 
 
 		 357 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  55.63 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  59.18 
 
 		 341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  59.12 
 
 		 343 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  59.12 
 
 		 343 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  59.18 
 
 		 341 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  59.18 
 
 		 341 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  58.84 
 
 		 341 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  54.09 
 
 		 343 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  54.09 
 
 		 343 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  58.84 
 
 		 342 aa  334  9e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  58.5 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  57.73 
 
 		 329 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  57.34 
 
 		 342 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  58.5 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  53.77 
 
 		 319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  57.81 
 
 		 334 aa  322  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  53.14 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  55.66 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  54.31 
 
 		 337 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  53.72 
 
 		 356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  51.32 
 
 		 333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  51.88 
 
 		 325 aa  302  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  54.46 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  54.03 
 
 		 340 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  53.21 
 
 		 342 aa  297  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  49.54 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  52.43 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  53.04 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  53.9 
 
 		 360 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  50.32 
 
 		 337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  48.99 
 
 		 327 aa  275  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  50.93 
 
 		 387 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  41.86 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  42.03 
 
 		 322 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  39.32 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  40.34 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  40.68 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  42.91 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  40.47 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  39.32 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  39.86 
 
 		 323 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  39.53 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  39.53 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  39.53 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  38.22 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  43.66 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  38.51 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  40.83 
 
 		 313 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  44.01 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  39.12 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  42.61 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  40.3 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  37.92 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  39.67 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  38.67 
 
 		 329 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  37.84 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  38.36 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  37.5 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  35.33 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  50 
 
 		 225 aa  152  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  35.46 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  35.53 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  36.09 
 
 		 366 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  35.69 
 
 		 390 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  35.56 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  35.56 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  37.36 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  35.56 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  35.12 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  33.62 
 
 		 368 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  34.38 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  33.82 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  34.12 
 
 		 373 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  40.45 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  38.23 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  45.4 
 
 		 176 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  34.91 
 
 		 374 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  34.48 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  33.24 
 
 		 386 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  44.31 
 
 		 233 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  35.03 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.71 
 
 		 230 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  35.13 
 
 		 385 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  45.28 
 
 		 231 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  27.84 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  43.71 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  29.27 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  35.21 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>