More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0451 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  100 
 
 
368 aa  699    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  74.25 
 
 
374 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  71 
 
 
373 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  70.73 
 
 
385 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  69.19 
 
 
386 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  69.19 
 
 
386 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  69.46 
 
 
386 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  67.95 
 
 
398 aa  472  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  67.3 
 
 
373 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  70.43 
 
 
385 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  67.57 
 
 
368 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  67.93 
 
 
366 aa  455  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  69.44 
 
 
380 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  63.07 
 
 
386 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  68.91 
 
 
363 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  62.83 
 
 
397 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  61.46 
 
 
390 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  66.4 
 
 
389 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  62.06 
 
 
369 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  60.05 
 
 
372 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  56.34 
 
 
372 aa  342  5.999999999999999e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  53.45 
 
 
425 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  53.33 
 
 
385 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  55.41 
 
 
381 aa  316  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  49.86 
 
 
357 aa  296  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  40.7 
 
 
367 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  51.58 
 
 
370 aa  289  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  49.48 
 
 
421 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  60.73 
 
 
266 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  45.37 
 
 
433 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  46.17 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  58.93 
 
 
483 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  44.29 
 
 
375 aa  239  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  44.01 
 
 
356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  46.77 
 
 
360 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  45.66 
 
 
402 aa  224  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  42.97 
 
 
369 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  40.34 
 
 
376 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  41.84 
 
 
323 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  41.3 
 
 
338 aa  189  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  41.46 
 
 
318 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  38.97 
 
 
306 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  39.6 
 
 
316 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  38.15 
 
 
340 aa  186  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  40.41 
 
 
342 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  39.03 
 
 
306 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  36.72 
 
 
388 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  39.94 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  38.11 
 
 
329 aa  176  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.04 
 
 
244 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  41.46 
 
 
248 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40.41 
 
 
240 aa  163  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  33.53 
 
 
398 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  31.72 
 
 
372 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  37.39 
 
 
453 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  35.39 
 
 
356 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  36.83 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  28.27 
 
 
386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  33.42 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  36.83 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  36.83 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  36.54 
 
 
315 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  36.54 
 
 
339 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  35.93 
 
 
370 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  36.54 
 
 
343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  36.54 
 
 
343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.79 
 
 
345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  34.99 
 
 
323 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  33.7 
 
 
382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  32.6 
 
 
340 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  26.49 
 
 
379 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  47.06 
 
 
225 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  29.5 
 
 
385 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.43 
 
 
340 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  34.4 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.5 
 
 
250 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  32.95 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  35.47 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  31 
 
 
389 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.32 
 
 
242 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  31.86 
 
 
346 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.35 
 
 
353 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  30.11 
 
 
400 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  34.4 
 
 
342 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  33.53 
 
 
340 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.56 
 
 
242 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  29.63 
 
 
372 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  42.79 
 
 
230 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  33.87 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  33.05 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  33.87 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  33.6 
 
 
341 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  35.04 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  33.33 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.35 
 
 
242 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  46.99 
 
 
228 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  33.78 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  34.29 
 
 
395 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  35.11 
 
 
402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  41.45 
 
 
233 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>