More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1555 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  100 
 
 
341 aa  684    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  41.28 
 
 
344 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  42.17 
 
 
354 aa  245  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  41.62 
 
 
346 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  39.77 
 
 
354 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  41.43 
 
 
362 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.61 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  39.1 
 
 
351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  39.19 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  37.27 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  38.18 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  38.55 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  34.54 
 
 
398 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  36.88 
 
 
307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  34.3 
 
 
356 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  46.99 
 
 
281 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  34.86 
 
 
342 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  40.1 
 
 
265 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  32.49 
 
 
372 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  35.08 
 
 
373 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  32.23 
 
 
374 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  32.94 
 
 
388 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  30.64 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0253  protein of unknown function DUF182  31.69 
 
 
337 aa  138  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0507983 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  31.25 
 
 
366 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  32.68 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.24 
 
 
364 aa  135  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  32.43 
 
 
397 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  46.84 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  32.25 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  44.67 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  33.43 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  32.83 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  32.11 
 
 
368 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  28.07 
 
 
379 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  30.08 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.04 
 
 
249 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  33.05 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  30.36 
 
 
306 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  34.16 
 
 
381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  32.49 
 
 
376 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  32.22 
 
 
386 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  32.22 
 
 
386 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  32.22 
 
 
386 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  32.51 
 
 
373 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  31.78 
 
 
329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  32.13 
 
 
385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  32.04 
 
 
385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  30.65 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  31.42 
 
 
382 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  30.88 
 
 
316 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  31.02 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  32.97 
 
 
372 aa  126  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  43.9 
 
 
246 aa  126  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  30.46 
 
 
365 aa  122  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  42.6 
 
 
263 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  42.5 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  33.13 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  26.84 
 
 
385 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  33.43 
 
 
363 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  39.16 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  30.08 
 
 
370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.18 
 
 
269 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  28.97 
 
 
372 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  31.04 
 
 
372 aa  116  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  29.91 
 
 
326 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  31.09 
 
 
395 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  29.63 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  29.24 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  26.63 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  36.9 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  30.73 
 
 
389 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  30.03 
 
 
370 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  30.08 
 
 
398 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.33 
 
 
402 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  42.51 
 
 
279 aa  113  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  34.52 
 
 
389 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  29.69 
 
 
389 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  29.01 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  28.07 
 
 
342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  37.44 
 
 
225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  28.45 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  37.97 
 
 
244 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  31.74 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  29.46 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  37.74 
 
 
240 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  29.57 
 
 
329 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  30.21 
 
 
338 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6767  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor XdhC/CoxF family-like protein  26.51 
 
 
339 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  25.81 
 
 
340 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  28.24 
 
 
340 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  29.18 
 
 
526 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  27.43 
 
 
341 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04230  hypothetical protein  39.07 
 
 
328 aa  106  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  27.43 
 
 
341 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  27.43 
 
 
341 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.76 
 
 
341 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  28.45 
 
 
453 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.46 
 
 
250 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>