More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1485 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  764    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40.5 
 
 
384 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  38.8 
 
 
249 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  47.2 
 
 
398 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  48.21 
 
 
281 aa  156  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  36.69 
 
 
269 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.79 
 
 
353 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  31.33 
 
 
354 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  43.42 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  41.42 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  31.78 
 
 
344 aa  126  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  42.53 
 
 
362 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  44.3 
 
 
286 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  42.5 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  34.97 
 
 
265 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  40.37 
 
 
354 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  39.39 
 
 
345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  40.38 
 
 
282 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  35.93 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  31.67 
 
 
351 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  36.21 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  32.78 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  37.43 
 
 
265 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  40.76 
 
 
307 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  32.19 
 
 
375 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0253  protein of unknown function DUF182  34.64 
 
 
337 aa  110  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0507983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  36.97 
 
 
244 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  33.67 
 
 
248 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  30.36 
 
 
279 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  35.12 
 
 
382 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  31.75 
 
 
246 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  36.6 
 
 
228 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.39 
 
 
364 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.11 
 
 
250 aa  102  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  30.53 
 
 
526 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  34.05 
 
 
388 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  33.71 
 
 
357 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  34.57 
 
 
382 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  31.28 
 
 
277 aa  100  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  28.81 
 
 
225 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  29.84 
 
 
395 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  31.98 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  32.66 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04230  hypothetical protein  29.06 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  29.46 
 
 
385 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  35.88 
 
 
376 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  35.44 
 
 
233 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  32.46 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  35.9 
 
 
323 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  33.82 
 
 
372 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.56 
 
 
233 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  34.84 
 
 
400 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  32.91 
 
 
233 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0727  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor XdhC/CoxF family-like protein  31.96 
 
 
329 aa  91.3  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.666329  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  36.94 
 
 
176 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  31.82 
 
 
425 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  29.76 
 
 
332 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  33.55 
 
 
372 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  36.31 
 
 
323 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  34.42 
 
 
242 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  33.54 
 
 
243 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  32.05 
 
 
390 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.69 
 
 
233 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  34.42 
 
 
329 aa  89.4  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  33.77 
 
 
242 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  32.69 
 
 
230 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  29.53 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  27.46 
 
 
370 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1569  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106179  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  34.42 
 
 
316 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.26 
 
 
230 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  34.16 
 
 
235 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  31.68 
 
 
386 aa  86.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  32.69 
 
 
230 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  30.65 
 
 
372 aa  85.9  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  30.81 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  33.53 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  32.74 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  30.77 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  31.43 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  31.61 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  35.29 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01780  hypothetical protein  34.01 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  29.61 
 
 
235 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  32.9 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2005  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  47.56 
 
 
109 aa  83.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0215568  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.17 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0029  hypothetical protein  26.6 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180579  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  33.11 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  25.75 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  32.68 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.9 
 
 
233 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  31.65 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6767  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor XdhC/CoxF family-like protein  32.52 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  29.15 
 
 
368 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  30.92 
 
 
369 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  29.89 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  31.79 
 
 
541 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.79 
 
 
541 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.79 
 
 
541 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>