275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1482 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  60 
 
 		 235 aa  265  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  55.61 
 
 		 231 aa  237  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  57.59 
 
 		 234 aa  233  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  55.75 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  53.57 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  55.51 
 
 		 242 aa  224  9e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  57.27 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  53.57 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  53.12 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  51.98 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  50.67 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  51.57 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  51.1 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  57.27 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  55.31 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  57.21 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  46.98 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  54.55 
 
 		 340 aa  198  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  47.22 
 
 		 342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  43.11 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  54.97 
 
 		 228 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  53.25 
 
 		 376 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  51.83 
 
 		 323 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  51.23 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  50.6 
 
 		 388 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  52.54 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  44.34 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  49.39 
 
 		 176 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  45.06 
 
 		 318 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  46.43 
 
 		 316 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  50.31 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  46.43 
 
 		 306 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  49.68 
 
 		 313 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  51.59 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  51.25 
 
 		 244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  45.83 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  47.02 
 
 		 356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.49 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  43.27 
 
 		 357 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  43.37 
 
 		 370 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  37.5 
 
 		 368 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  42.19 
 
 		 368 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.24 
 
 		 340 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  41.53 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  39.6 
 
 		 374 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  40 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  41.14 
 
 		 343 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  41.14 
 
 		 343 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  40 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.63 
 
 		 345 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  46.26 
 
 		 389 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  41.14 
 
 		 341 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  41.14 
 
 		 338 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  41.14 
 
 		 341 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  38.36 
 
 		 367 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  44.9 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  40.11 
 
 		 372 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  38.3 
 
 		 373 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  40.25 
 
 		 366 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  42.77 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  40.62 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  39.88 
 
 		 372 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  37.44 
 
 		 340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  40 
 
 		 453 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  42.58 
 
 		 425 aa  118  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  37.95 
 
 		 340 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  45.21 
 
 		 338 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  40.99 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  40.74 
 
 		 386 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  38.3 
 
 		 380 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  40.49 
 
 		 356 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  41.72 
 
 		 326 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  41.25 
 
 		 373 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  40.51 
 
 		 342 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  39.6 
 
 		 389 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  35.34 
 
 		 385 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  46.07 
 
 		 360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  38.18 
 
 		 397 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  43.05 
 
 		 329 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  42.17 
 
 		 340 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  38.12 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  40 
 
 		 364 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  41.82 
 
 		 387 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  36.97 
 
 		 337 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  36.24 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  40 
 
 		 323 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  42 
 
 		 312 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  39.39 
 
 		 421 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  46.34 
 
 		 375 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  44 
 
 		 360 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  37.85 
 
 		 343 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  38.29 
 
 		 343 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  37.85 
 
 		 343 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  38.36 
 
 		 369 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  39.63 
 
 		 342 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  39.88 
 
 		 341 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  34.69 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  40.96 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  39.66 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>