More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5448 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  100 
 
 
228 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  81.58 
 
 
242 aa  352  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  69.74 
 
 
242 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  68.72 
 
 
242 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  65.93 
 
 
233 aa  287  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  65.65 
 
 
233 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  65.04 
 
 
233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  65.49 
 
 
233 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  63.72 
 
 
230 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  67.84 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  63.84 
 
 
234 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  70.24 
 
 
233 aa  264  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  64.41 
 
 
235 aa  262  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  60.62 
 
 
230 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  60.18 
 
 
230 aa  257  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  53.15 
 
 
250 aa  224  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  55.75 
 
 
235 aa  221  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  56.11 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  50 
 
 
225 aa  209  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  51.79 
 
 
231 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  49.55 
 
 
342 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  54.8 
 
 
318 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  51.35 
 
 
323 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  50.89 
 
 
388 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  55.08 
 
 
323 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  52.74 
 
 
329 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  56.5 
 
 
176 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  57.65 
 
 
376 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  58.24 
 
 
228 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  52.86 
 
 
216 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  55.62 
 
 
313 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  56.44 
 
 
240 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  56.02 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  46.19 
 
 
248 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  55.56 
 
 
316 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  54.82 
 
 
306 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  46.61 
 
 
244 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  50.31 
 
 
356 aa  151  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  51.53 
 
 
370 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  48.08 
 
 
425 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  44.92 
 
 
357 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  44.26 
 
 
374 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  42.05 
 
 
372 aa  134  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  49.37 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  44.44 
 
 
340 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  45.81 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  43.18 
 
 
319 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  44.94 
 
 
380 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  45.86 
 
 
368 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  46.58 
 
 
266 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  43.93 
 
 
397 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  46.88 
 
 
342 aa  132  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  46.15 
 
 
366 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  44.03 
 
 
340 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  52.23 
 
 
389 aa  131  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  45.2 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  46.39 
 
 
390 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  44.17 
 
 
368 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  43.02 
 
 
386 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  44.17 
 
 
421 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  43.4 
 
 
340 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  45.14 
 
 
339 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  44.02 
 
 
372 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  45.18 
 
 
385 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  45.14 
 
 
315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  41.36 
 
 
373 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  51.7 
 
 
338 aa  128  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  44.03 
 
 
345 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  45.91 
 
 
343 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  46.55 
 
 
385 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  45.91 
 
 
343 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  45.91 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  45.91 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  48.41 
 
 
381 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  48.68 
 
 
329 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  45.28 
 
 
341 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  46.54 
 
 
312 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  47.24 
 
 
483 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  52.98 
 
 
360 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  44.59 
 
 
367 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  43.35 
 
 
386 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  43.35 
 
 
386 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  39.19 
 
 
386 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  44.03 
 
 
453 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  47.79 
 
 
334 aa  122  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  45.81 
 
 
363 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  44.07 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  51.74 
 
 
375 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  45.03 
 
 
356 aa  118  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  44.03 
 
 
343 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  43.5 
 
 
341 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  43.19 
 
 
433 aa  118  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  41.76 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  43.5 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  43.59 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  43.58 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  43.59 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  43.5 
 
 
341 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  43.5 
 
 
341 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  46.15 
 
 
331 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>