More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4304 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  650    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  59.56 
 
 		 327 aa  378  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  56.01 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  55.25 
 
 		 340 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  54.86 
 
 		 453 aa  338  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  54.09 
 
 		 341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  54.4 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  53.77 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  51.72 
 
 		 340 aa  332  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  53.89 
 
 		 343 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  53.89 
 
 		 343 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  55.17 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  52.04 
 
 		 340 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  53.65 
 
 		 338 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  53.77 
 
 		 343 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  53.77 
 
 		 343 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  54.23 
 
 		 342 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  54.09 
 
 		 341 aa  322  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  53.77 
 
 		 342 aa  322  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  53.46 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  53.46 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  53.14 
 
 		 341 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  53.14 
 
 		 341 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  53.61 
 
 		 341 aa  318  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  53.44 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  55.1 
 
 		 315 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  50.31 
 
 		 333 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  51.82 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  53.73 
 
 		 339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  53.77 
 
 		 343 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  49.23 
 
 		 329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  51.88 
 
 		 312 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  50.47 
 
 		 357 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  48.74 
 
 		 319 aa  300  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  51.57 
 
 		 337 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  53.09 
 
 		 342 aa  291  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  52.2 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  50.93 
 
 		 340 aa  288  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  51.26 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  47.5 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  48.99 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  50.31 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  51.68 
 
 		 360 aa  275  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  47.26 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  43.94 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  39.94 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  39.45 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  39.57 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  39.45 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  39.63 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  39.32 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  39.32 
 
 		 323 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  41.59 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  42.39 
 
 		 316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  37.42 
 
 		 322 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  41.75 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  40.06 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  42.07 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  38.8 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  35.89 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  39.14 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  40.13 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  39 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  37.1 
 
 		 350 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  36.26 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  38.2 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  37.3 
 
 		 323 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  37.85 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  36.28 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  36.09 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  35.1 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  33.8 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  30.28 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  35.18 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  33.05 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  33.05 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  33.62 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  33.15 
 
 		 390 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  35.16 
 
 		 375 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  31.93 
 
 		 386 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  31.82 
 
 		 374 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  45.1 
 
 		 225 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  31.74 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  45.21 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  32.1 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  32.1 
 
 		 386 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  32.1 
 
 		 386 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  46.91 
 
 		 228 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  45.7 
 
 		 242 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  32.77 
 
 		 363 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  45 
 
 		 243 aa  126  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  45.33 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  32.01 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  43.64 
 
 		 176 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  31.78 
 
 		 368 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  37.32 
 
 		 360 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  34.56 
 
 		 389 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  44.67 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  40.7 
 
 		 230 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.53 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>