288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6028 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  55.36 
 
 
235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  55.61 
 
 
235 aa  237  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  53.33 
 
 
234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  51.77 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  49.32 
 
 
230 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  48.43 
 
 
230 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  49.12 
 
 
233 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  47.98 
 
 
233 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  49.1 
 
 
250 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  48.43 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  48.4 
 
 
230 aa  198  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  46.49 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  51.1 
 
 
242 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  50.67 
 
 
242 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  57.47 
 
 
228 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  51.09 
 
 
243 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  50.22 
 
 
340 aa  185  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  45.09 
 
 
225 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  46.7 
 
 
388 aa  178  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  49.02 
 
 
233 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  43.69 
 
 
342 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  54.14 
 
 
376 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  51.57 
 
 
329 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  53.25 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  47.03 
 
 
216 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  45.14 
 
 
318 aa  155  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  49.68 
 
 
323 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  47.54 
 
 
323 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  50.96 
 
 
313 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  48.41 
 
 
316 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  49.04 
 
 
176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  48.7 
 
 
356 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  47.13 
 
 
306 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  47.13 
 
 
306 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  47.24 
 
 
240 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  45.68 
 
 
381 aa  131  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  42.14 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  45.28 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  37.97 
 
 
340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.45 
 
 
345 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  44.64 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  38.04 
 
 
340 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.7 
 
 
266 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  44.59 
 
 
329 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.45 
 
 
244 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  43.03 
 
 
370 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  44.3 
 
 
319 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  40.72 
 
 
326 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  42.33 
 
 
342 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  42.14 
 
 
341 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  38.14 
 
 
357 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  41.38 
 
 
340 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  43.31 
 
 
386 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  40.88 
 
 
453 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  40.62 
 
 
356 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  41.51 
 
 
339 aa  121  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  41.51 
 
 
315 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  41.51 
 
 
343 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  41.51 
 
 
341 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  41.51 
 
 
343 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  40.36 
 
 
368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  41.51 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  44.79 
 
 
368 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  43.87 
 
 
389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  40.23 
 
 
373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  40.11 
 
 
374 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  41.38 
 
 
372 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  39.29 
 
 
343 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  39.29 
 
 
343 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  39.29 
 
 
343 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  45.83 
 
 
338 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  39.87 
 
 
372 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  40.65 
 
 
366 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  38.42 
 
 
340 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  39.13 
 
 
342 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  40.99 
 
 
327 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  38.82 
 
 
325 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  41.1 
 
 
367 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  41.88 
 
 
390 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  43.62 
 
 
389 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  42.28 
 
 
369 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  40.25 
 
 
385 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  40.25 
 
 
387 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  40 
 
 
425 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  41.14 
 
 
385 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  40.26 
 
 
369 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  35.85 
 
 
364 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  42.41 
 
 
380 aa  108  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  39.29 
 
 
341 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  37.33 
 
 
334 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  42.94 
 
 
421 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  37.82 
 
 
333 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  38.93 
 
 
323 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  36.6 
 
 
322 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  36.36 
 
 
483 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  38.1 
 
 
341 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  38.69 
 
 
341 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  38.69 
 
 
341 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  38.93 
 
 
323 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>