288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1633 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  99.38 
 
 		 323 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  93.5 
 
 		 323 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  87.31 
 
 		 323 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  81.42 
 
 		 323 aa  524  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  81.73 
 
 		 323 aa  524  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  77.09 
 
 		 323 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  59.13 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  59.32 
 
 		 322 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  56.66 
 
 		 323 aa  362  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  58.51 
 
 		 320 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  59.82 
 
 		 326 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  53.58 
 
 		 350 aa  332  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  49.54 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  39.45 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  40.37 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  41.25 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  37.96 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  40.12 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.62 
 
 		 340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  36.73 
 
 		 340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  39.75 
 
 		 326 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  37.23 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  41.12 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.58 
 
 		 341 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  37.77 
 
 		 453 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  37.58 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.27 
 
 		 341 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  40.25 
 
 		 331 aa  208  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  36.65 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  37.27 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  37.27 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  37.3 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  38.63 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  39.25 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  36.56 
 
 		 343 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  36.56 
 
 		 343 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.49 
 
 		 345 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  37.07 
 
 		 341 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  37.38 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  37.35 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  37.38 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  37.38 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  36.76 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  39.94 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  37.15 
 
 		 341 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  38.34 
 
 		 340 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  36.67 
 
 		 342 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  39.53 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  38.46 
 
 		 357 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  39.82 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  38.99 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  40.24 
 
 		 339 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  37.71 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  40.12 
 
 		 360 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  35.78 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  34.82 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  39.1 
 
 		 316 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  35.41 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  37.99 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  37.34 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  35.14 
 
 		 388 aa  156  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  34.73 
 
 		 342 aa  155  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1887  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  69.64 
 
 		 112 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  37.07 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  31.82 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  35.45 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  33.8 
 
 		 385 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  33.01 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  33.71 
 
 		 366 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  34.91 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  33.02 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  33.24 
 
 		 356 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  36.93 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  29.66 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  32.76 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  31.36 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  31.9 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  32.66 
 
 		 386 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  30.79 
 
 		 385 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  32.05 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  33.62 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  31.09 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  33.14 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  33.14 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  32.86 
 
 		 386 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  31.92 
 
 		 370 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  32.03 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  32.04 
 
 		 398 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  32.95 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  31.56 
 
 		 373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.31 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  29.79 
 
 		 357 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.35 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  40.97 
 
 		 225 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  31.12 
 
 		 373 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  37.89 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  31.53 
 
 		 389 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  38.93 
 
 		 231 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  42.38 
 
 		 176 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>