More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1636 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  82.89 
 
 
233 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  83.56 
 
 
233 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  83.33 
 
 
233 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  82.02 
 
 
233 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  81.3 
 
 
230 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  78.7 
 
 
230 aa  367  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  64 
 
 
242 aa  275  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  63.56 
 
 
242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  62.83 
 
 
242 aa  270  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  57.73 
 
 
250 aa  261  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  55.61 
 
 
234 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  62.67 
 
 
243 aa  254  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  56.25 
 
 
235 aa  245  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  62.62 
 
 
233 aa  244  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  63.72 
 
 
228 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  53.57 
 
 
235 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  51.14 
 
 
342 aa  211  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  49.32 
 
 
231 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  49.78 
 
 
340 aa  203  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  48.21 
 
 
225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  50.45 
 
 
323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  46.35 
 
 
388 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  52.31 
 
 
329 aa  187  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  47.25 
 
 
318 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  52.12 
 
 
376 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  53.11 
 
 
176 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  50.25 
 
 
323 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  51.48 
 
 
228 aa  179  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  52.23 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  47.83 
 
 
216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  44.86 
 
 
306 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  49.69 
 
 
356 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  43.78 
 
 
316 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  43.78 
 
 
306 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.24 
 
 
248 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  43.84 
 
 
372 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  43.02 
 
 
386 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  48.43 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  47.77 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  39.26 
 
 
340 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  44.31 
 
 
326 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.62 
 
 
340 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  38.65 
 
 
340 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  41.1 
 
 
341 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  39.91 
 
 
373 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  44.17 
 
 
370 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  39.44 
 
 
366 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  47.9 
 
 
389 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.25 
 
 
345 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  42.86 
 
 
319 aa  131  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  40.49 
 
 
339 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.48 
 
 
266 aa  131  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  40.49 
 
 
315 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  40.49 
 
 
338 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  39.88 
 
 
453 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  38.42 
 
 
368 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  40.49 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  40.49 
 
 
341 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  40.49 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  38.19 
 
 
374 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  42.5 
 
 
389 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  40.44 
 
 
380 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  43.71 
 
 
312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  42.5 
 
 
425 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  41.44 
 
 
385 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  36.73 
 
 
385 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  41.53 
 
 
368 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  41.57 
 
 
329 aa  128  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  41.85 
 
 
390 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  39.39 
 
 
343 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  41.76 
 
 
340 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  37.5 
 
 
372 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  40.86 
 
 
357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  43.45 
 
 
342 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  41.34 
 
 
373 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  41.51 
 
 
342 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  43.09 
 
 
375 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  40.49 
 
 
342 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  42.11 
 
 
331 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  45.06 
 
 
381 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  39.61 
 
 
343 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  40.25 
 
 
341 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  39.61 
 
 
343 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  40.88 
 
 
341 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  40.88 
 
 
341 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  40.88 
 
 
341 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  37.84 
 
 
386 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  39.52 
 
 
337 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  37.84 
 
 
386 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  37.84 
 
 
386 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  41.03 
 
 
367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  35.16 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  41.67 
 
 
483 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  40.88 
 
 
341 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  40.25 
 
 
341 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  40.49 
 
 
333 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  37.11 
 
 
323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  39.52 
 
 
322 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  39.38 
 
 
356 aa  118  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>