More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0331 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  628  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  85.14 
 
 
323 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  68.52 
 
 
329 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  66.25 
 
 
318 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  61.49 
 
 
342 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  52.11 
 
 
376 aa  314  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  85.8 
 
 
176 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  49.7 
 
 
340 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  45.45 
 
 
388 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  48.9 
 
 
316 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  47.32 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  47.32 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  47.99 
 
 
313 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  53.85 
 
 
225 aa  232  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1934  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  84.96 
 
 
133 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0140126  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  41.14 
 
 
356 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  37.9 
 
 
340 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  40.35 
 
 
366 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.26 
 
 
345 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  40.51 
 
 
373 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  40.51 
 
 
341 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  39.81 
 
 
342 aa  212  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  39.37 
 
 
453 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  41.14 
 
 
341 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  40.51 
 
 
343 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  40.51 
 
 
343 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  40.19 
 
 
341 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  40.19 
 
 
338 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  40.51 
 
 
339 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  41.14 
 
 
341 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  41.14 
 
 
341 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  40.51 
 
 
342 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  39.05 
 
 
319 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  36.59 
 
 
340 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  40.12 
 
 
390 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  40.13 
 
 
340 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  38.85 
 
 
340 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  40.51 
 
 
341 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  41.01 
 
 
341 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  40.19 
 
 
341 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  52.49 
 
 
242 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  39.24 
 
 
326 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  38.22 
 
 
386 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  38.29 
 
 
373 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  37.46 
 
 
369 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  37.68 
 
 
368 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  40.98 
 
 
357 aa  200  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  39.33 
 
 
372 aa  199  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  40.12 
 
 
329 aa  199  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  41.08 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  38.66 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  49.55 
 
 
230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  39.83 
 
 
363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  39.37 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  50.68 
 
 
242 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  37.66 
 
 
343 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  37.66 
 
 
343 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  41.46 
 
 
331 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  48.17 
 
 
233 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  37.39 
 
 
374 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  38.9 
 
 
386 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  38.9 
 
 
386 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  34.32 
 
 
367 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  38.82 
 
 
386 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  49.08 
 
 
233 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  48.17 
 
 
233 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  36.75 
 
 
425 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  48.4 
 
 
233 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  38.11 
 
 
357 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  40.74 
 
 
312 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  41.9 
 
 
381 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  40.72 
 
 
370 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  48.87 
 
 
234 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  37.21 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  59.88 
 
 
228 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  36.49 
 
 
385 aa  189  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  57.06 
 
 
228 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  37.29 
 
 
397 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  37.39 
 
 
385 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  47.3 
 
 
242 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  50.72 
 
 
243 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  39.45 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  39.12 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  36.76 
 
 
337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  36.39 
 
 
364 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  47.09 
 
 
230 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  37.85 
 
 
385 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  46.36 
 
 
230 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  36.33 
 
 
333 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  40.62 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  39.88 
 
 
368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  44.34 
 
 
250 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  39.82 
 
 
389 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  40.13 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  39.32 
 
 
360 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  35.68 
 
 
421 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  39.6 
 
 
380 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  36.12 
 
 
372 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  41.23 
 
 
360 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  40.17 
 
 
389 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>