244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1934 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  257  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1934  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  100 
 
 		 133 aa  256  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0140126  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  86.49 
 
 		 323 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  62.79 
 
 		 342 aa  153  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  69.44 
 
 		 329 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  65.77 
 
 		 318 aa  137  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2603  hypothetical protein  62.75 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3674  hypothetical protein  61.76 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5314  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  60.78 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1635  hypothetical protein  63.37 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272897  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1786  hypothetical protein  61.76 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0365077  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4322  protein of unknown function DUF182  61.76 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  55.47 
 
 		 376 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1754  protein of unknown function DUF182  60.95 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5447  hypothetical protein  60.95 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.27292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0987  protein of unknown function DUF182  59.05 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0403063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  53.85 
 
 		 340 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1185  protein of unknown function DUF182  59.05 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.567555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2957  hypothetical protein  58.65 
 
 		 111 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1055  hypothetical protein  58.1 
 
 		 107 aa  121  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.115133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1483  hypothetical protein  63.54 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0215592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2201  hypothetical protein  58.82 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1292  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  62.89 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0353078  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3470  hypothetical protein  60 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.362357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3909  hypothetical protein  59.8 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2903  hypothetical protein  56.44 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.223725 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6029  protein of unknown function DUF182  61.29 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  51.67 
 
 		 316 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  45.53 
 
 		 388 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0964  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  57.78 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  47.62 
 
 		 373 aa  103  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  49.17 
 
 		 306 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  55.43 
 
 		 390 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  46.72 
 
 		 319 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  49.61 
 
 		 369 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  52 
 
 		 483 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  42.4 
 
 		 340 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  47.41 
 
 		 386 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  49.61 
 
 		 366 aa  99.8  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  51.96 
 
 		 306 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2838  protein of unknown function DUF182  53.4 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  51.96 
 
 		 356 aa  97.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  47.9 
 
 		 385 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0473  hypothetical protein  47.52 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0459384  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  44.21 
 
 		 367 aa  95.9  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  45.93 
 
 		 373 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  47.32 
 
 		 331 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  47.06 
 
 		 386 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  47.01 
 
 		 421 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  47.06 
 
 		 386 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  47.06 
 
 		 386 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  52.94 
 
 		 385 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0502  hypothetical protein  52.69 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  46.27 
 
 		 398 aa  94.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  44.78 
 
 		 374 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  46.77 
 
 		 363 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1257  hypothetical protein  51.09 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  45.6 
 
 		 360 aa  93.6  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  46.83 
 
 		 372 aa  93.6  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  45.1 
 
 		 341 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  45.1 
 
 		 341 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  45.1 
 
 		 341 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  48.94 
 
 		 334 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  45.1 
 
 		 342 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  48.74 
 
 		 385 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  43.55 
 
 		 337 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  41.75 
 
 		 337 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  44.12 
 
 		 341 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  44.12 
 
 		 341 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  45.6 
 
 		 368 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  46.3 
 
 		 356 aa  90.9  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  47.96 
 
 		 326 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  41.09 
 
 		 334 aa  90.5  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.38 
 
 		 345 aa  90.5  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0116  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  48.91 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.390223  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  43.75 
 
 		 342 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  46.09 
 
 		 357 aa  89.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  46.3 
 
 		 360 aa  90.1  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  43.97 
 
 		 325 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  45.04 
 
 		 313 aa  88.6  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  44.25 
 
 		 357 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  43.93 
 
 		 453 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  43.14 
 
 		 341 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  47.92 
 
 		 329 aa  87.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  39.66 
 
 		 340 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  44.76 
 
 		 338 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  44.76 
 
 		 341 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  44.76 
 
 		 341 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  38.21 
 
 		 343 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  44.76 
 
 		 343 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  38.21 
 
 		 343 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  45.28 
 
 		 433 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  44.76 
 
 		 339 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  44.76 
 
 		 343 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  52.81 
 
 		 425 aa  87  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  45.45 
 
 		 397 aa  87  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  53.72 
 
 		 380 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  58.54 
 
 		 381 aa  87  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  44.79 
 
 		 339 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  44.33 
 
 		 372 aa  84.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>