255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1257 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1257  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  207  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0502  hypothetical protein  95.19 
 
 		 104 aa  200  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2838  protein of unknown function DUF182  78.43 
 
 		 103 aa  165  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  56.86 
 
 		 356 aa  120  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  56.31 
 
 		 385 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0473  hypothetical protein  57.43 
 
 		 110 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0459384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5314  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  53.47 
 
 		 107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  52 
 
 		 360 aa  110  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4322  protein of unknown function DUF182  53.92 
 
 		 108 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3674  hypothetical protein  52.48 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1786  hypothetical protein  52.48 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0365077  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  53.4 
 
 		 398 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0116  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  49.04 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.390223  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  50.98 
 
 		 357 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  53.47 
 
 		 340 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1754  protein of unknown function DUF182  53.47 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  51.96 
 
 		 366 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  53.85 
 
 		 372 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3909  hypothetical protein  53.92 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1635  hypothetical protein  54 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272897  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6029  protein of unknown function DUF182  55.88 
 
 		 109 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5447  hypothetical protein  54.08 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.27292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3470  hypothetical protein  52.94 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.362357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  50.98 
 
 		 386 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  47.06 
 
 		 483 aa  105  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0964  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  55 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2957  hypothetical protein  52.53 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  52.94 
 
 		 376 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  51.96 
 
 		 385 aa  104  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  50 
 
 		 316 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  51.96 
 
 		 373 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1292  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  54.46 
 
 		 112 aa  103  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0353078  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1055  hypothetical protein  50.5 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.115133 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2201  hypothetical protein  52.48 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  52.43 
 
 		 386 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1483  hypothetical protein  51.49 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0215592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1185  protein of unknown function DUF182  50.5 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.567555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2603  hypothetical protein  51 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  52.43 
 
 		 386 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  52.43 
 
 		 386 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0987  protein of unknown function DUF182  50.5 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0403063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  53.92 
 
 		 368 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  49.51 
 
 		 373 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  56.63 
 
 		 363 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  50.49 
 
 		 374 aa  101  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  50.51 
 
 		 306 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2903  hypothetical protein  49.5 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.223725 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  49.02 
 
 		 367 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  49.49 
 
 		 425 aa  100  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  49.49 
 
 		 306 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  48.04 
 
 		 381 aa  100  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  43.4 
 
 		 385 aa  98.6  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  49.02 
 
 		 390 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  46.15 
 
 		 433 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  52.17 
 
 		 329 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  46.6 
 
 		 397 aa  96.7  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  58 
 
 		 389 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  53.26 
 
 		 318 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  51.09 
 
 		 323 aa  94.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  50.98 
 
 		 369 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1934  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  51.09 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0140126  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  52.17 
 
 		 342 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  46.08 
 
 		 356 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  52.17 
 
 		 323 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  43.43 
 
 		 388 aa  90.5  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  56 
 
 		 368 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  46.6 
 
 		 421 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  44.76 
 
 		 370 aa  88.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  57.78 
 
 		 380 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  45 
 
 		 372 aa  85.5  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  41.58 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2005  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.62 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0215568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  41.18 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  41.18 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  41.58 
 
 		 345 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  41.58 
 
 		 340 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  43.97 
 
 		 402 aa  80.5  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.59 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  40.4 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  46.46 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  41.58 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  42.16 
 
 		 341 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  41.18 
 
 		 337 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  42.16 
 
 		 341 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  42.16 
 
 		 341 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  43.64 
 
 		 341 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  43.64 
 
 		 341 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  43.64 
 
 		 341 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  42.16 
 
 		 342 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  40.4 
 
 		 334 aa  77  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  39.42 
 
 		 340 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  40.2 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  36.84 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  44.09 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  37.14 
 
 		 372 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  45.19 
 
 		 313 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  41.41 
 
 		 319 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  42.7 
 
 		 370 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  40.43 
 
 		 323 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  40.2 
 
 		 453 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>