210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1055 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1055  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.115133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0987  protein of unknown function DUF182  99.07 
 
 		 107 aa  206  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0403063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1185  protein of unknown function DUF182  99.07 
 
 		 107 aa  206  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.567555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3470  hypothetical protein  84.11 
 
 		 107 aa  181  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.362357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1754  protein of unknown function DUF182  82.24 
 
 		 107 aa  175  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5447  hypothetical protein  81.13 
 
 		 107 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.27292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2903  hypothetical protein  76.7 
 
 		 105 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.223725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3674  hypothetical protein  71.7 
 
 		 107 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5314  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  72.64 
 
 		 107 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4322  protein of unknown function DUF182  72.9 
 
 		 108 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1483  hypothetical protein  80.2 
 
 		 110 aa  159  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0215592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1786  hypothetical protein  71.7 
 
 		 107 aa  159  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0365077  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3909  hypothetical protein  75.7 
 
 		 113 aa  159  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1635  hypothetical protein  72.64 
 
 		 107 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272897  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2201  hypothetical protein  70.75 
 
 		 107 aa  154  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2603  hypothetical protein  69.81 
 
 		 110 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6029  protein of unknown function DUF182  75 
 
 		 109 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1292  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  73 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0353078  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  68.93 
 
 		 340 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2957  hypothetical protein  60.58 
 
 		 111 aa  133  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0964  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  63.73 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65592  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  53.77 
 
 		 329 aa  123  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  59.18 
 
 		 376 aa  123  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1934  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  58.1 
 
 		 133 aa  121  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0140126  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  58.1 
 
 		 323 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  58.42 
 
 		 316 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  57.73 
 
 		 356 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  58.1 
 
 		 323 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0473  hypothetical protein  51.43 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0459384  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  54.46 
 
 		 306 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  55.45 
 
 		 306 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  53.85 
 
 		 318 aa  110  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  48 
 
 		 367 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1257  hypothetical protein  50.5 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  49.52 
 
 		 342 aa  101  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0502  hypothetical protein  49.5 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2838  protein of unknown function DUF182  49 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  47.62 
 
 		 319 aa  96.7  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  46.53 
 
 		 357 aa  95.5  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  47 
 
 		 373 aa  93.6  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  44 
 
 		 388 aa  93.2  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  43.52 
 
 		 341 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  43.52 
 
 		 342 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  43.52 
 
 		 341 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  44.9 
 
 		 360 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  43.52 
 
 		 341 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  49.11 
 
 		 313 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  47 
 
 		 386 aa  90.9  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  42.59 
 
 		 341 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  42.59 
 
 		 341 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  42.59 
 
 		 341 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  45.54 
 
 		 385 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  40.37 
 
 		 356 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  46.43 
 
 		 372 aa  88.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  44.14 
 
 		 334 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0116  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  46.24 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.390223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  46.53 
 
 		 385 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  48.51 
 
 		 390 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  41 
 
 		 483 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  40.37 
 
 		 337 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  44.44 
 
 		 329 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  39.25 
 
 		 342 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.6 
 
 		 345 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  43.56 
 
 		 398 aa  84.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  39.25 
 
 		 340 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  45 
 
 		 366 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  47.92 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  42.2 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  42.45 
 
 		 453 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  43.4 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.25 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  40.74 
 
 		 339 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  40.74 
 
 		 343 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  41.67 
 
 		 341 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  41.67 
 
 		 341 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  40.74 
 
 		 343 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  42.16 
 
 		 338 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  36.11 
 
 		 343 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  36.11 
 
 		 343 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  45 
 
 		 385 aa  80.9  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  38.32 
 
 		 340 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  45 
 
 		 386 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  45 
 
 		 386 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  45 
 
 		 386 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  44.44 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  38.46 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  43.56 
 
 		 397 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  44.44 
 
 		 389 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  38.53 
 
 		 339 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  40.19 
 
 		 357 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  40.2 
 
 		 433 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  45.45 
 
 		 363 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  45 
 
 		 368 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  37.5 
 
 		 340 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  40.95 
 
 		 360 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  42.86 
 
 		 331 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  44 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  39.25 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  35.09 
 
 		 364 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  39.62 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>