More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1688 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  100 
 
 
372 aa  710    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  54.97 
 
 
373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  54.06 
 
 
374 aa  352  4e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  53.39 
 
 
386 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  53.51 
 
 
386 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  53.51 
 
 
386 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  55.43 
 
 
397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  55.03 
 
 
385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  55.4 
 
 
366 aa  334  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  53.99 
 
 
398 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  56.4 
 
 
368 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  52.33 
 
 
373 aa  328  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  51.96 
 
 
390 aa  325  9e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  54.24 
 
 
363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  51.42 
 
 
369 aa  312  6.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  53.7 
 
 
389 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  50.81 
 
 
386 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  52.11 
 
 
380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  48.66 
 
 
385 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  50.41 
 
 
372 aa  298  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  49.58 
 
 
368 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  50.99 
 
 
357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  44.78 
 
 
425 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  47.63 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  47.27 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  46.56 
 
 
385 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  39.44 
 
 
367 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  42.97 
 
 
421 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  43.68 
 
 
389 aa  233  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  42.49 
 
 
433 aa  224  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  41.04 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  41.55 
 
 
375 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  47.64 
 
 
266 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  47.28 
 
 
483 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  42.26 
 
 
402 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  38.2 
 
 
376 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  38.59 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  41.93 
 
 
360 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  38.81 
 
 
323 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  36.72 
 
 
318 aa  176  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  36.16 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  36.12 
 
 
323 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  35.84 
 
 
340 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  35.91 
 
 
342 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.35 
 
 
244 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.16 
 
 
248 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  54.49 
 
 
338 aa  162  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  31.88 
 
 
372 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  34.22 
 
 
356 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  35.73 
 
 
306 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  35.36 
 
 
306 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.2 
 
 
240 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  36.58 
 
 
341 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  36.58 
 
 
338 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.53 
 
 
345 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  34.02 
 
 
340 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  36.73 
 
 
331 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  36.28 
 
 
341 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  31.74 
 
 
340 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  35.99 
 
 
343 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  32.34 
 
 
340 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  35.99 
 
 
343 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  36.36 
 
 
339 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  36.28 
 
 
315 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  34.93 
 
 
370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  32.78 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  27.97 
 
 
379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  34.51 
 
 
453 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  34.13 
 
 
357 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.14 
 
 
340 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  33.62 
 
 
325 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  34.22 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  53.7 
 
 
228 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  33.82 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  30.56 
 
 
319 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  32.35 
 
 
364 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  34.71 
 
 
360 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  32.04 
 
 
342 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  29.2 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  32.16 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  31.52 
 
 
329 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  29.43 
 
 
400 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  34.29 
 
 
337 aa  135  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  29.7 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  33.04 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  33.82 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  33.04 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  32.75 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  30.34 
 
 
351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  34.08 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  32.45 
 
 
341 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.24 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  33.73 
 
 
329 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.5 
 
 
228 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  32.1 
 
 
365 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  27.97 
 
 
398 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  32.4 
 
 
332 aa  132  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.81 
 
 
233 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  32.46 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  33.04 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>