More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1528 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  100 
 
 
365 aa  741    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  46.43 
 
 
372 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  46.26 
 
 
370 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  34.99 
 
 
382 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  35.47 
 
 
389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  30.77 
 
 
379 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  32.23 
 
 
386 aa  172  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  32.09 
 
 
385 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  35.75 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  35.03 
 
 
395 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  32.43 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  33.15 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  34.96 
 
 
395 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  30.16 
 
 
367 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  33.42 
 
 
373 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  31.62 
 
 
386 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  31.62 
 
 
386 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  31.62 
 
 
386 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  34.82 
 
 
366 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  32.61 
 
 
390 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  30.81 
 
 
398 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  31.56 
 
 
386 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  33.99 
 
 
368 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  32.39 
 
 
332 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  30.46 
 
 
356 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  33.79 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  32.64 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  31.79 
 
 
385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  34.55 
 
 
316 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  33.33 
 
 
370 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  30.16 
 
 
374 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  31.27 
 
 
341 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  32.6 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  32.07 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  32 
 
 
372 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  31.06 
 
 
373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  33.07 
 
 
385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  33.93 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  32.65 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  33.94 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  33.13 
 
 
340 aa  133  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  31.5 
 
 
357 aa  133  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.3 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  30.87 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  31.28 
 
 
385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  30.96 
 
 
340 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  32.53 
 
 
323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  28.4 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  29.18 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  30.65 
 
 
345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  31.97 
 
 
363 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  29.63 
 
 
397 aa  126  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  29.23 
 
 
319 aa  126  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  31.3 
 
 
368 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.02 
 
 
347 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  30.08 
 
 
341 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  30.24 
 
 
342 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  32.34 
 
 
389 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  37.14 
 
 
244 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  30.05 
 
 
347 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  30.43 
 
 
380 aa  122  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  30.56 
 
 
341 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  31.53 
 
 
334 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  30.93 
 
 
341 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  30.65 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  30.56 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  30.56 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  30.3 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  30.51 
 
 
342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  30.3 
 
 
453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.27 
 
 
240 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  30 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  30.3 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  29.7 
 
 
341 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  30 
 
 
339 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  29.76 
 
 
340 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  30 
 
 
342 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  28 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  30.63 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  30.03 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  29.63 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  30.21 
 
 
337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  29.48 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  31.58 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  29.82 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  25.96 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.03 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  29.54 
 
 
315 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  31.85 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0061  hypothetical protein  31.27 
 
 
337 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  31.29 
 
 
334 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  30.61 
 
 
323 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  31.66 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  30.63 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  32.25 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  29.79 
 
 
307 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  28.01 
 
 
343 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  28.01 
 
 
343 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  30.7 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  35.59 
 
 
265 aa  109  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>