More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0117 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  100 
 
 
266 aa  523  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  63.97 
 
 
366 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  61.45 
 
 
368 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  60.87 
 
 
373 aa  296  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  60.73 
 
 
368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  62.25 
 
 
385 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  60.08 
 
 
386 aa  281  8.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  57.48 
 
 
374 aa  280  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  57.47 
 
 
386 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  57.47 
 
 
386 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  57.47 
 
 
386 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  58.5 
 
 
385 aa  274  9e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  55.43 
 
 
380 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  59.02 
 
 
369 aa  269  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  59.84 
 
 
389 aa  265  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  56.11 
 
 
372 aa  265  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  56.42 
 
 
397 aa  261  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  56.98 
 
 
425 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  57.43 
 
 
373 aa  259  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  54.41 
 
 
390 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  53.65 
 
 
483 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  54.65 
 
 
381 aa  246  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  57.25 
 
 
363 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  51.22 
 
 
398 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  44.44 
 
 
367 aa  231  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  51.37 
 
 
385 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  48 
 
 
370 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  47.64 
 
 
372 aa  216  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  55.12 
 
 
357 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  45.24 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  55.2 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  45.38 
 
 
248 aa  195  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.32 
 
 
240 aa  192  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  44.26 
 
 
389 aa  191  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  51.41 
 
 
356 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  43.95 
 
 
433 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  44.84 
 
 
375 aa  175  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  45.62 
 
 
421 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  39.06 
 
 
369 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  46.53 
 
 
360 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  41.84 
 
 
338 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  40.83 
 
 
250 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  49.67 
 
 
225 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  38.52 
 
 
372 aa  148  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  44.38 
 
 
230 aa  145  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  42.63 
 
 
233 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  47.56 
 
 
228 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  40.11 
 
 
233 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.94 
 
 
235 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.46 
 
 
230 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  45.56 
 
 
228 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.09 
 
 
242 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  46.79 
 
 
230 aa  142  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  40.54 
 
 
233 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  42.56 
 
 
235 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  44.72 
 
 
318 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  47.5 
 
 
234 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  40.46 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.55 
 
 
242 aa  138  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  39.61 
 
 
231 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  40.53 
 
 
342 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  43.5 
 
 
388 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.64 
 
 
242 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.11 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.65 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  39.57 
 
 
376 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  45.1 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  45.1 
 
 
176 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  43.79 
 
 
323 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  43.14 
 
 
329 aa  132  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  43.23 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  42.58 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  34.55 
 
 
249 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  44.3 
 
 
316 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  36.57 
 
 
379 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  39.47 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  35.83 
 
 
400 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  37.1 
 
 
216 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  38.66 
 
 
332 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  44.16 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  42.77 
 
 
343 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  42.77 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  42.77 
 
 
343 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  40.25 
 
 
340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  42.77 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  42.14 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  38.29 
 
 
372 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.59 
 
 
353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  42.14 
 
 
341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  42.14 
 
 
341 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  42.33 
 
 
453 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  39.62 
 
 
340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  31.97 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  43.71 
 
 
313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  39.39 
 
 
346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  33.46 
 
 
365 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  31.51 
 
 
384 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  41.77 
 
 
356 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  33.73 
 
 
398 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  38.55 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>