More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2902 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  100 
 
 
250 aa  493  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  58.19 
 
 
230 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  55.83 
 
 
233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  53.25 
 
 
233 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  58.9 
 
 
242 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  57.44 
 
 
242 aa  259  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  54.31 
 
 
233 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  53.88 
 
 
233 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  53.02 
 
 
230 aa  258  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  53.28 
 
 
230 aa  257  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  56.6 
 
 
243 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  53.22 
 
 
234 aa  241  9e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  51.53 
 
 
235 aa  239  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  51.91 
 
 
242 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  52.99 
 
 
228 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  48.67 
 
 
342 aa  215  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  51.13 
 
 
233 aa  215  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  49.78 
 
 
231 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  47.13 
 
 
235 aa  207  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  47.88 
 
 
388 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  48.55 
 
 
340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  57.14 
 
 
329 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  57.89 
 
 
228 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  42.68 
 
 
376 aa  192  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  46.96 
 
 
323 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  45.49 
 
 
225 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  45.34 
 
 
318 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  53.14 
 
 
176 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  48.62 
 
 
323 aa  174  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  43.78 
 
 
306 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  52.76 
 
 
356 aa  168  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  48.19 
 
 
306 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  41.15 
 
 
316 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  45.05 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  51.55 
 
 
240 aa  158  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  48.41 
 
 
313 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  41.67 
 
 
248 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  41.28 
 
 
244 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  37.05 
 
 
368 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  40.82 
 
 
372 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  45.66 
 
 
370 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  49.03 
 
 
425 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  45.14 
 
 
380 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  44.19 
 
 
386 aa  141  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  42.5 
 
 
368 aa  141  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  36.63 
 
 
374 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  44.9 
 
 
357 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  40.09 
 
 
373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  45.2 
 
 
326 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  41.63 
 
 
381 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  42.64 
 
 
390 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  36.71 
 
 
366 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.61 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  44.57 
 
 
342 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  41.46 
 
 
340 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  42.86 
 
 
385 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  42.21 
 
 
367 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  39.46 
 
 
385 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  38.15 
 
 
340 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  44.94 
 
 
483 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  43.03 
 
 
421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  41.46 
 
 
345 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  43.24 
 
 
372 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  38.62 
 
 
341 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  45.68 
 
 
433 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.17 
 
 
353 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  50.62 
 
 
360 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  41.67 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  43.18 
 
 
373 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  37.21 
 
 
340 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  42.67 
 
 
319 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  38.1 
 
 
338 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  38.1 
 
 
343 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  38.1 
 
 
339 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  42.08 
 
 
329 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  38.1 
 
 
343 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  38.1 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  38.1 
 
 
341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  39.67 
 
 
397 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  44.89 
 
 
363 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  42.61 
 
 
386 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  39.39 
 
 
386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  37.04 
 
 
453 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  39.39 
 
 
386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  46.58 
 
 
338 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  36.36 
 
 
369 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  42.5 
 
 
389 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  45.16 
 
 
389 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  43.27 
 
 
385 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  43.71 
 
 
369 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  41.94 
 
 
342 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  40.61 
 
 
312 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  35.27 
 
 
323 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  41.94 
 
 
341 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  41.94 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  41.94 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  41.94 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  44.67 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  42.76 
 
 
323 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  40.74 
 
 
327 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>