More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6196 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  766    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  76.5 
 
 		 369 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  69.21 
 
 		 366 aa  490  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  66.94 
 
 		 386 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  66.94 
 
 		 386 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  66.94 
 
 		 386 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  65.85 
 
 		 374 aa  475  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  67.75 
 
 		 373 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  65.68 
 
 		 385 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  65.4 
 
 		 368 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  64.96 
 
 		 373 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  64.65 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  66.39 
 
 		 380 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  60.26 
 
 		 390 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  64.97 
 
 		 385 aa  435  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  60.31 
 
 		 386 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  66.4 
 
 		 368 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  60.7 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  63.99 
 
 		 363 aa  411  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  60.59 
 
 		 372 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  51.6 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  53.7 
 
 		 372 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  52.07 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  53.23 
 
 		 385 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  44.72 
 
 		 367 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  52.52 
 
 		 381 aa  329  4e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  49.87 
 
 		 370 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  54.68 
 
 		 483 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  44.84 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  59.84 
 
 		 266 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  42.9 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  42.82 
 
 		 421 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  44.1 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  39.62 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  44.55 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  43.99 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  39.73 
 
 		 369 aa  212  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  40.57 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  40.4 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  40.22 
 
 		 376 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  37.89 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  38.07 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  36.44 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  39.94 
 
 		 323 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  38.21 
 
 		 318 aa  190  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  37.15 
 
 		 340 aa  189  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  34.81 
 
 		 340 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  45.34 
 
 		 248 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.98 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  40 
 
 		 338 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  36.26 
 
 		 345 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  44.07 
 
 		 244 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  35.62 
 
 		 453 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.33 
 
 		 341 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  30.79 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  34.71 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  36.44 
 
 		 341 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  35.05 
 
 		 339 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  34.34 
 
 		 343 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  34.34 
 
 		 343 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  35.05 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  36.71 
 
 		 342 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.05 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  36.44 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  36.44 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  34.52 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  34.52 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  36.44 
 
 		 341 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  36.16 
 
 		 341 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  36.61 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40.76 
 
 		 240 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  33.71 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  35.53 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  33.33 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  35.88 
 
 		 329 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  36.13 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  34.49 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  31.99 
 
 		 372 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  35.03 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  32.8 
 
 		 372 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  32.23 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  35.55 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  34.15 
 
 		 327 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  36.9 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  30.25 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  35.04 
 
 		 331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  35.89 
 
 		 370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  34.97 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  33.7 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  29.95 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  34.56 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  47.93 
 
 		 225 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  35.16 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  32.38 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.52 
 
 		 353 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  33.42 
 
 		 340 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  35.13 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  35.38 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  31.43 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  44.15 
 
 		 233 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>