More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0986 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  100 
 
 
243 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  90.38 
 
 
242 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  89.12 
 
 
242 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  61.32 
 
 
233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  61.57 
 
 
242 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  64.44 
 
 
233 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  63.56 
 
 
233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  64.44 
 
 
233 aa  271  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  62.67 
 
 
230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  61.33 
 
 
230 aa  267  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  61.78 
 
 
230 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  69.16 
 
 
233 aa  265  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  62.11 
 
 
234 aa  260  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  68.14 
 
 
228 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  59.83 
 
 
235 aa  251  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  56.6 
 
 
250 aa  245  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  57.27 
 
 
235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  55.11 
 
 
342 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  52.94 
 
 
340 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  50.22 
 
 
225 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  55.17 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  53.81 
 
 
323 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  50.65 
 
 
231 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  51.61 
 
 
388 aa  195  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  54.75 
 
 
318 aa  193  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  58.99 
 
 
176 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  56.42 
 
 
376 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  55.62 
 
 
323 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  59.26 
 
 
228 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  58.86 
 
 
313 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  51.65 
 
 
216 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  55.56 
 
 
240 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  51.79 
 
 
356 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  52.12 
 
 
306 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  51.88 
 
 
316 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  50.91 
 
 
306 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  50 
 
 
248 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  47.64 
 
 
244 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  41.78 
 
 
374 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  41.78 
 
 
386 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  41.44 
 
 
373 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  41.63 
 
 
385 aa  135  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  44.39 
 
 
373 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  43.24 
 
 
372 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  41.53 
 
 
368 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  38.5 
 
 
366 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  44.38 
 
 
380 aa  131  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  52.2 
 
 
360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  42.25 
 
 
372 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  43.71 
 
 
425 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  41.9 
 
 
390 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  43.72 
 
 
385 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.32 
 
 
340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  43.59 
 
 
421 aa  128  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  47.88 
 
 
389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  42.7 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  43.71 
 
 
368 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  45 
 
 
325 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  41.08 
 
 
397 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.32 
 
 
266 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.78 
 
 
345 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  40.65 
 
 
340 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  44.85 
 
 
370 aa  124  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  42.27 
 
 
433 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  43.26 
 
 
357 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  43.23 
 
 
341 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  44.38 
 
 
386 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  45.35 
 
 
329 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  43.6 
 
 
389 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  40 
 
 
340 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  44.38 
 
 
386 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  40.97 
 
 
386 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  42.63 
 
 
483 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  44.23 
 
 
312 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  48.34 
 
 
338 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  44.44 
 
 
381 aa  121  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  44.51 
 
 
363 aa  121  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  43.79 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  41.94 
 
 
453 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  42.58 
 
 
341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  40.34 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  42.78 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  40.34 
 
 
367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  42.58 
 
 
343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  42.58 
 
 
343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  40.34 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  42.58 
 
 
338 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  43.21 
 
 
369 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  40.85 
 
 
342 aa  116  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  44.16 
 
 
398 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  43.23 
 
 
342 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  36.31 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  41.21 
 
 
369 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  42.58 
 
 
341 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  41.94 
 
 
343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  42.58 
 
 
341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  42.02 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  42.58 
 
 
341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  41.94 
 
 
343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  36.27 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>