290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3910 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  100 
 
 
234 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  64.29 
 
 
242 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  63.27 
 
 
242 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  54.71 
 
 
233 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  62.83 
 
 
242 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  55.16 
 
 
233 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  56.5 
 
 
233 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  55.61 
 
 
230 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  54.71 
 
 
233 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  62.11 
 
 
243 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  54.26 
 
 
230 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  53.81 
 
 
230 aa  242  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  63.84 
 
 
228 aa  239  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  57.59 
 
 
235 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  56.84 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  61.23 
 
 
233 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  53.22 
 
 
250 aa  227  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  53.33 
 
 
231 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  52.05 
 
 
340 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  48.88 
 
 
342 aa  201  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  44.89 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  52.17 
 
 
329 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  45.31 
 
 
376 aa  182  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  47.06 
 
 
323 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  49.5 
 
 
323 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  46.61 
 
 
318 aa  178  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  45.37 
 
 
388 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  53.76 
 
 
228 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  49.53 
 
 
216 aa  175  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  52.2 
 
 
176 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  51.59 
 
 
313 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  53.75 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  45.5 
 
 
316 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  48.66 
 
 
248 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  48.13 
 
 
244 aa  154  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  44.5 
 
 
306 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  44.5 
 
 
306 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  47.56 
 
 
356 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  44.44 
 
 
389 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  40 
 
 
366 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  42.86 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  45 
 
 
370 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  44.38 
 
 
425 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  46.1 
 
 
381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  38.71 
 
 
368 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  49.33 
 
 
338 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  42.17 
 
 
386 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  46.2 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  47.17 
 
 
329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  43.64 
 
 
380 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  40.27 
 
 
373 aa  128  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  47.27 
 
 
390 aa  128  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  44.24 
 
 
372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  45.52 
 
 
266 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  42.13 
 
 
357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  44.81 
 
 
319 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  47.06 
 
 
421 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  42.24 
 
 
340 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  42.04 
 
 
340 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  42.04 
 
 
345 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  40.8 
 
 
397 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  40.72 
 
 
340 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  42.68 
 
 
385 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  41.61 
 
 
340 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  42.42 
 
 
373 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  42.42 
 
 
372 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  45.03 
 
 
342 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  43.86 
 
 
368 aa  121  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  41.44 
 
 
385 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  42.59 
 
 
356 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  43.11 
 
 
341 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  39.73 
 
 
367 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  40.43 
 
 
312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  42.24 
 
 
483 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  42.76 
 
 
389 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  45.39 
 
 
320 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  41.67 
 
 
369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  42.51 
 
 
453 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  45.27 
 
 
340 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  44.44 
 
 
331 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  42.51 
 
 
338 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  42.51 
 
 
341 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  39.74 
 
 
323 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  36.17 
 
 
386 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  36.17 
 
 
386 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  36.17 
 
 
386 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  45.09 
 
 
433 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  41.32 
 
 
339 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  41.32 
 
 
343 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  42.86 
 
 
327 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  41.32 
 
 
343 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  43.18 
 
 
360 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  46.28 
 
 
375 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  41.32 
 
 
315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  39.35 
 
 
323 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  36.51 
 
 
249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  46.2 
 
 
334 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  39.35 
 
 
323 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  41.18 
 
 
343 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  38.46 
 
 
322 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>