More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1005 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  707    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  50.14 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  46.9 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  41.79 
 
 		 346 aa  249  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  43.57 
 
 		 375 aa  235  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  41.94 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  38.92 
 
 		 344 aa  226  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  39.1 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  40.41 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  37.85 
 
 		 353 aa  205  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  34.49 
 
 		 376 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  33.9 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  32.21 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  35.14 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  51.66 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  33.24 
 
 		 356 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  33.73 
 
 		 265 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38 
 
 		 384 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  31.23 
 
 		 357 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.69 
 
 		 364 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  30.97 
 
 		 372 aa  136  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  29.5 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  45.91 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  30.34 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  33.62 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  29.91 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  30.79 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  31.1 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.76 
 
 		 249 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  31.67 
 
 		 374 aa  119  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.5 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  31.09 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  29.18 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  26.74 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  31.99 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  28.8 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  27.03 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.54 
 
 		 269 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  30.66 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  32.52 
 
 		 244 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  29.63 
 
 		 372 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  34.71 
 
 		 240 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  29.48 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  30.63 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  29.48 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  27.86 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  29.12 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  29.12 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  29.12 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  29.68 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  29.14 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  44.9 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  29.07 
 
 		 381 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  29.32 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  26.59 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  28.61 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  27.65 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.12 
 
 		 248 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  34.6 
 
 		 246 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  26.76 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  28.97 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  30.09 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  27.08 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  29.83 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  26.99 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  27.65 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  26.76 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  35.26 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  27.03 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  28.7 
 
 		 369 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  29.15 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  30.64 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  27.88 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  28.06 
 
 		 319 aa  103  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  27.97 
 
 		 421 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  29.39 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0253  protein of unknown function DUF182  28.4 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0507983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  28.91 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  39.73 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  29.17 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  27.11 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  40 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  28.17 
 
 		 526 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  33.54 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  26.97 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  25.99 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  26.73 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04230  hypothetical protein  35.29 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  28.48 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  27.68 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  28.48 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  26.11 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  35.71 
 
 		 235 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  27.98 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  26.11 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  36.56 
 
 		 231 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.68 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  27.06 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01780  hypothetical protein  34.87 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  27.96 
 
 		 306 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>