More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_61120 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  96.9 
 
 
323 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  81.73 
 
 
323 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  81.42 
 
 
323 aa  524  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  79.57 
 
 
323 aa  519  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  79.57 
 
 
323 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  80.8 
 
 
323 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  59.75 
 
 
322 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  60.74 
 
 
326 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  58.13 
 
 
322 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  56.97 
 
 
323 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  58.2 
 
 
320 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  52.65 
 
 
350 aa  325  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  51.23 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  39.32 
 
 
325 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  40.37 
 
 
327 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  39.45 
 
 
356 aa  222  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  42.5 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  37.93 
 
 
340 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.35 
 
 
340 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  39.56 
 
 
326 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  41.01 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  38.46 
 
 
453 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  41.19 
 
 
334 aa  212  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  36.68 
 
 
340 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  38.32 
 
 
341 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  39.06 
 
 
341 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  38.01 
 
 
341 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  38.32 
 
 
339 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  40.88 
 
 
331 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  38.2 
 
 
343 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.8 
 
 
345 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  38.2 
 
 
343 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  38.44 
 
 
341 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  38.05 
 
 
338 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  38.44 
 
 
341 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  38.44 
 
 
341 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  38.44 
 
 
341 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  37.19 
 
 
319 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  38.12 
 
 
342 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  38.12 
 
 
341 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  37.19 
 
 
343 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  37.19 
 
 
343 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  40.91 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  40.12 
 
 
337 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  38.7 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  39.86 
 
 
312 aa  195  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  40.12 
 
 
340 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  38.56 
 
 
337 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  39.69 
 
 
357 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  39.58 
 
 
342 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  35.49 
 
 
342 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  38.85 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  39.2 
 
 
339 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  36.99 
 
 
343 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  38.94 
 
 
360 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  35.29 
 
 
364 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  38.54 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  35.69 
 
 
374 aa  169  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  38.22 
 
 
306 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  38.26 
 
 
306 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  37.25 
 
 
366 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  36.29 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  36.49 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  38.39 
 
 
323 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1887  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  69.64 
 
 
112 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  35.8 
 
 
368 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  34.46 
 
 
385 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  33.55 
 
 
342 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  32.35 
 
 
388 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  33.64 
 
 
340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  37.23 
 
 
356 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  35.11 
 
 
386 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  35.11 
 
 
386 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  34.83 
 
 
386 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  35.36 
 
 
398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  34.97 
 
 
386 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  34.15 
 
 
369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  34.67 
 
 
323 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  31.44 
 
 
367 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  33.88 
 
 
318 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  38.33 
 
 
338 aa  142  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  34.47 
 
 
376 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  32.82 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  32.51 
 
 
397 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  37.39 
 
 
372 aa  139  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  31.99 
 
 
390 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  35.22 
 
 
313 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  36.13 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  34.44 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  33.15 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  33.9 
 
 
370 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  33.81 
 
 
363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  33.53 
 
 
373 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  31.01 
 
 
372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  31.07 
 
 
357 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  33.8 
 
 
380 aa  119  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  38.14 
 
 
233 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.38 
 
 
250 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  37.11 
 
 
230 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>