More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4534 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  776    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  72.15 
 
 
364 aa  524  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  69.51 
 
 
340 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  61.69 
 
 
356 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  59.61 
 
 
337 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  59.23 
 
 
339 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  54.03 
 
 
453 aa  362  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  51.06 
 
 
345 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  52.91 
 
 
340 aa  359  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  53.76 
 
 
341 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  51.62 
 
 
340 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  53.49 
 
 
341 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  58.71 
 
 
360 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  53.66 
 
 
338 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  53.76 
 
 
339 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  51.52 
 
 
340 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  53.74 
 
 
343 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  53.74 
 
 
343 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  52.96 
 
 
341 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  52.96 
 
 
341 aa  342  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  52.69 
 
 
341 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  52.68 
 
 
343 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  52.96 
 
 
341 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  52.68 
 
 
343 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  51.62 
 
 
342 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  52.69 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  52.69 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  52.42 
 
 
342 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  53.6 
 
 
315 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  52.96 
 
 
343 aa  316  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  49.27 
 
 
325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  48.31 
 
 
357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  50.93 
 
 
312 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  49.15 
 
 
331 aa  300  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  49.85 
 
 
327 aa  299  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  45.89 
 
 
326 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  47.81 
 
 
329 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  43.93 
 
 
319 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  46.38 
 
 
333 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  48.55 
 
 
337 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  49.71 
 
 
340 aa  288  9e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  47.98 
 
 
342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  47.83 
 
 
334 aa  276  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  44.69 
 
 
334 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  37.36 
 
 
323 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  36.21 
 
 
323 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  35.43 
 
 
322 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  35.24 
 
 
322 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  36.49 
 
 
323 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  36.21 
 
 
323 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  36.21 
 
 
323 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  37.17 
 
 
342 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  35.63 
 
 
323 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  35.92 
 
 
323 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  35.24 
 
 
326 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  36.2 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  34.42 
 
 
388 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  35.45 
 
 
323 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  35.08 
 
 
376 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  34.19 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  36.8 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  35.84 
 
 
320 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  36.83 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  36.31 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  36.53 
 
 
306 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  32.58 
 
 
350 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  33.74 
 
 
318 aa  163  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  33.54 
 
 
313 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  31.42 
 
 
356 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  32.35 
 
 
329 aa  155  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  33.24 
 
 
357 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  33.95 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  47.02 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  31.44 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  32.14 
 
 
372 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  33.7 
 
 
366 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  27.72 
 
 
367 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  32.38 
 
 
374 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  32.46 
 
 
373 aa  143  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  33.24 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  32.36 
 
 
368 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  46.01 
 
 
228 aa  140  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  33.25 
 
 
386 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  33.25 
 
 
386 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  33.25 
 
 
386 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  30.81 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  32.37 
 
 
385 aa  136  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  35.13 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  32.8 
 
 
363 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  32.43 
 
 
369 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  29.84 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  45.35 
 
 
216 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  32.41 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  30.37 
 
 
397 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  40.25 
 
 
231 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  31.07 
 
 
389 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.62 
 
 
233 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.23 
 
 
234 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  40.37 
 
 
230 aa  123  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  40.62 
 
 
233 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>