297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4020 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  715    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  54.06 
 
 		 323 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  53.27 
 
 		 323 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  53.58 
 
 		 323 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  51.67 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  52.65 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  52.65 
 
 		 323 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  52.02 
 
 		 323 aa  322  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  51.88 
 
 		 323 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  50.16 
 
 		 322 aa  318  6e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  49.7 
 
 		 323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  49.84 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  49.22 
 
 		 326 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  46.71 
 
 		 329 aa  281  9e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  36.78 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  40.13 
 
 		 337 aa  199  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  38.94 
 
 		 331 aa  196  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  34.66 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  37.65 
 
 		 453 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  37.1 
 
 		 325 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  38.22 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.23 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  36.7 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  37.38 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  37.58 
 
 		 339 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  36.92 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  37.13 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  36.96 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  33.89 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  37.13 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  36.34 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  34.06 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  35.71 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  36.29 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  36.2 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  36.45 
 
 		 341 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  35.78 
 
 		 343 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  35.78 
 
 		 343 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  37.13 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  36.45 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  38.07 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  36.45 
 
 		 341 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  36.45 
 
 		 341 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  38.07 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  38.69 
 
 		 315 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  34.45 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  35.69 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  36.89 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  35.84 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  35.84 
 
 		 341 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  36 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  34.8 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  37.27 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  35.31 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  36.51 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  35.52 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  34.23 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  32.76 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  33.54 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  32.17 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1887  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  67 
 
 		 112 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  33.54 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  33.54 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  32.58 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  31.73 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  33.43 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  30.88 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  29.54 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  32.86 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  31.53 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  31.32 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  31.67 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  34.58 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  32.33 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  33.24 
 
 		 385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  30.25 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  29.71 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  30.3 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  29.95 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  29.73 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  30.18 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  30.18 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  30.18 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  29.17 
 
 		 340 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  29.49 
 
 		 373 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  30.75 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  32.81 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  29.74 
 
 		 357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  30.06 
 
 		 381 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  29.04 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  30.73 
 
 		 363 aa  116  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  29.21 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  31.62 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  39.88 
 
 		 240 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  28 
 
 		 397 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.07 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  28.42 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  29.52 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  27.79 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>