More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5263 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  96.9 
 
 
323 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  82.04 
 
 
323 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  81.73 
 
 
323 aa  524  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  78.95 
 
 
323 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  81.73 
 
 
323 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  79.57 
 
 
323 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  59.75 
 
 
322 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  58.2 
 
 
320 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  60.43 
 
 
326 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  58.13 
 
 
322 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  56.66 
 
 
323 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  52.02 
 
 
350 aa  322  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  51.23 
 
 
329 aa  322  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  39.32 
 
 
325 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  39.09 
 
 
356 aa  222  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  40.62 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  37.93 
 
 
340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  42.11 
 
 
329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.27 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  39.25 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  40.69 
 
 
333 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  38.23 
 
 
453 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  40.88 
 
 
334 aa  209  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  36.68 
 
 
340 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  38.01 
 
 
341 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  38.07 
 
 
339 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.69 
 
 
341 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  38.58 
 
 
341 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  40.57 
 
 
331 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  37.96 
 
 
343 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  37.96 
 
 
343 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  37.74 
 
 
338 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  36.88 
 
 
319 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  37.96 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  37.07 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  37.07 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  37.96 
 
 
341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  37.96 
 
 
341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  37.46 
 
 
342 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  37.96 
 
 
341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.31 
 
 
345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  37.65 
 
 
341 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  40.19 
 
 
357 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  40.3 
 
 
340 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  40.12 
 
 
337 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  39.53 
 
 
312 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  38.36 
 
 
334 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  40.18 
 
 
340 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  38.56 
 
 
315 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  37.89 
 
 
337 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  35.83 
 
 
342 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  39.58 
 
 
342 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  39.38 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  36.96 
 
 
343 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  39.2 
 
 
360 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  35.29 
 
 
364 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  38.54 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  38.22 
 
 
306 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  38.26 
 
 
306 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  35.41 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  35.91 
 
 
385 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  35.92 
 
 
387 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  36.57 
 
 
366 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1887  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  69.64 
 
 
112 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  38.08 
 
 
323 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  33.33 
 
 
340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  32.65 
 
 
388 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  34.86 
 
 
368 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  34.18 
 
 
385 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  33.23 
 
 
342 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  34.83 
 
 
386 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  36.92 
 
 
356 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  34.83 
 
 
386 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  34.55 
 
 
386 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  35.26 
 
 
386 aa  145  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  34.26 
 
 
323 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  31.64 
 
 
367 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  33.22 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  34.81 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  33.54 
 
 
369 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  37.39 
 
 
372 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  35.55 
 
 
313 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  31.9 
 
 
329 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  35.03 
 
 
376 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  31.43 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  36.93 
 
 
338 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  32.23 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  33.84 
 
 
368 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  33.91 
 
 
373 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  35.55 
 
 
389 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  32.87 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  33.05 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  33.52 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  30.72 
 
 
372 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  30.77 
 
 
357 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  38.66 
 
 
233 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  33.33 
 
 
375 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.38 
 
 
250 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  36.6 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>