More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0253 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0253  protein of unknown function DUF182  100 
 
 		 337 aa  697    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0507983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  31.69 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  30.99 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.46 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  29.11 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  31.87 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  29.59 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.63 
 
 		 364 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  29.09 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  40.49 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  37.17 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  29.82 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  26.17 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.1 
 
 		 249 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  30.74 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  29.92 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  31.28 
 
 		 362 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  27.35 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  39.74 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  29.07 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  29.77 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  40.65 
 
 		 282 aa  113  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  27.87 
 
 		 367 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.19 
 
 		 384 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  28.66 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  28.53 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  36.11 
 
 		 269 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  33.96 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  26.79 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  27.64 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  26.97 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  26.51 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  28.37 
 
 		 373 aa  99.4  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  25.99 
 
 		 389 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  39.49 
 
 		 376 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  25.81 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  27.71 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6767  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor XdhC/CoxF family-like protein  25.16 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.85 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  25.68 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  26.77 
 
 		 453 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  31.79 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  26.14 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  25.76 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  22.99 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  27.25 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  29.61 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  25.6 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  27.13 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.54 
 
 		 341 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  26.4 
 
 		 385 aa  92.8  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 338 aa  92.4  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  27.44 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  25.72 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  25.16 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  34.52 
 
 		 279 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  27.02 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  26.81 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  26.51 
 
 		 376 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  26.57 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  27.91 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  27.78 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  26.17 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  27.07 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  27.61 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  25.89 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  27.44 
 
 		 341 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  25.73 
 
 		 318 aa  89.7  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  27.44 
 
 		 341 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  27.44 
 
 		 341 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  41.88 
 
 		 279 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  27.13 
 
 		 341 aa  89.4  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  26.61 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  31.61 
 
 		 253 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  24.86 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  24.56 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  26.05 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  27.94 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  26.07 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  26.05 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  25.76 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  39.74 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  27.62 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.13 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  27.79 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  39.13 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  25.55 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  26.77 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  26.77 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  26.01 
 
 		 372 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  26.86 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  25.33 
 
 		 433 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  37.34 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  26.21 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  26.21 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  26.58 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  25.81 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  38.1 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.73 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  28.12 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>