286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1813 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  93.55 
 
 
291 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  80.22 
 
 
285 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  77.58 
 
 
281 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  77.86 
 
 
281 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  78.55 
 
 
276 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  77.5 
 
 
281 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  76.51 
 
 
281 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  74.28 
 
 
279 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  74.91 
 
 
279 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  69.96 
 
 
280 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  60.08 
 
 
255 aa  315  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.76 
 
 
298 aa  272  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  48.99 
 
 
313 aa  249  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  44.83 
 
 
309 aa  236  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  43.3 
 
 
331 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  38.05 
 
 
343 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  44.89 
 
 
288 aa  222  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  42.76 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  44.05 
 
 
275 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.48 
 
 
288 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.81 
 
 
334 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  42.54 
 
 
278 aa  205  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  40.13 
 
 
334 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  38.51 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.52 
 
 
294 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  36.69 
 
 
682 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  36.69 
 
 
682 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.62 
 
 
334 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  42.75 
 
 
327 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  40.37 
 
 
289 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  44.19 
 
 
268 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  40.15 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  35.83 
 
 
342 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  39.6 
 
 
290 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40 
 
 
283 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.86 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  40.62 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  52.03 
 
 
220 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.26 
 
 
338 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  52.41 
 
 
188 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  38.98 
 
 
256 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  50.68 
 
 
220 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  51.72 
 
 
200 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  32.28 
 
 
328 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  50.68 
 
 
211 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  51.03 
 
 
205 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.93 
 
 
267 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  51.03 
 
 
222 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  51.03 
 
 
222 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  51.03 
 
 
222 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  48.5 
 
 
339 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.47 
 
 
470 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.65 
 
 
196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.22 
 
 
279 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  41.6 
 
 
278 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.45 
 
 
336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.2 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  39.66 
 
 
283 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.02 
 
 
287 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  49.33 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.2 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  43.64 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.8 
 
 
285 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.46 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.67 
 
 
344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  44.2 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  46.62 
 
 
340 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  46.62 
 
 
340 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  45.95 
 
 
340 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  45.95 
 
 
381 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  45.95 
 
 
340 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  45.95 
 
 
381 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  45.95 
 
 
381 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.3 
 
 
267 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.15 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  35.14 
 
 
311 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  34.07 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40 
 
 
341 aa  125  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  35.89 
 
 
271 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  36.48 
 
 
248 aa  122  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  35.51 
 
 
313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.51 
 
 
337 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  34.72 
 
 
253 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  35.87 
 
 
313 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  33.98 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  35.87 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  34.41 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  36.21 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  32.92 
 
 
526 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  32.18 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  32.13 
 
 
277 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2834  protein of unknown function DUF182  31.01 
 
 
253 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  33.6 
 
 
282 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  29.71 
 
 
265 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  30.3 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  30.6 
 
 
265 aa  90.1  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.77 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  34.88 
 
 
346 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.35 
 
 
541 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>