More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2137 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  530  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2834  protein of unknown function DUF182  73.91 
 
 		 253 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  36.33 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  33.2 
 
 		 526 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  31.05 
 
 		 277 aa  128  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  34.16 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  33.98 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  31.56 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  32.14 
 
 		 265 aa  119  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.98 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  35.52 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  34.1 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  33.85 
 
 		 313 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.75 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  35.21 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  30.89 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  34.72 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.21 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.44 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  32.44 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  32.17 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.31 
 
 		 281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.08 
 
 		 281 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  32.95 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.33 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  32.68 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  29.66 
 
 		 279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  30.31 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  32.73 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  29.02 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  32.05 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  30.68 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  31.18 
 
 		 309 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  28.34 
 
 		 541 aa  101  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  28.34 
 
 		 541 aa  101  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.34 
 
 		 541 aa  101  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.34 
 
 		 541 aa  101  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  28.34 
 
 		 541 aa  101  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.34 
 
 		 541 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.34 
 
 		 541 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  28.34 
 
 		 541 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.57 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.32 
 
 		 279 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.29 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  27.17 
 
 		 306 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  32.31 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  26.45 
 
 		 306 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  27.63 
 
 		 298 aa  92.4  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  26.39 
 
 		 316 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  30.95 
 
 		 345 aa  91.3  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.37 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  27.94 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.94 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  30.08 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  27.48 
 
 		 339 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  32 
 
 		 341 aa  87  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.72 
 
 		 280 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  31.97 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  28.48 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.37 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  31.84 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  31.29 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  30.06 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  29.45 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  27.73 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  26.62 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  25 
 
 		 331 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  28.08 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  30.68 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  32.34 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  24.38 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.97 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  26.2 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  28.33 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  27.34 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  28.84 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  28.82 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  25.95 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  26.02 
 
 		 367 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  28.09 
 
 		 341 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  26.29 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  31.97 
 
 		 354 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1569  hypothetical protein  29.39 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  26.28 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  28.24 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  28.24 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  25.9 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  28.24 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  25.9 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  27.88 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  27.71 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  27.49 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  26.8 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  26.8 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0029  hypothetical protein  25.1 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180579  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  30.12 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  32.67 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  31.68 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>