More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6767 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6767  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor XdhC/CoxF family-like protein  100 
 
 
339 aa  704    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  27.56 
 
 
353 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  26.85 
 
 
354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  26.51 
 
 
341 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  24.43 
 
 
346 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  25.96 
 
 
382 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  28.53 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  24.51 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  24.06 
 
 
286 aa  97.1  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  27.48 
 
 
338 aa  96.3  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  33.56 
 
 
398 aa  96.3  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  23.38 
 
 
362 aa  95.9  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  34.12 
 
 
384 aa  95.9  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  25.71 
 
 
351 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  25.79 
 
 
344 aa  94  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.87 
 
 
269 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  26.43 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  27.24 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  27.24 
 
 
323 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  32.21 
 
 
265 aa  89.7  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  26.92 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  25.99 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  32.67 
 
 
249 aa  86.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  31.17 
 
 
354 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  25.47 
 
 
342 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  27.39 
 
 
323 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  34.34 
 
 
246 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  25.3 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  27.3 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  26.09 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  26.77 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  27.07 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  28.92 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  32.45 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  25 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  26.23 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  32.45 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  24.34 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  24.17 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  32.52 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  26.2 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  31.52 
 
 
281 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  25.15 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  25.81 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  24.46 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  24.4 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  24.78 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  23.66 
 
 
526 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  24.84 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  23.26 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  24.44 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  24.69 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  24.05 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  25.54 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  24.44 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  31.14 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  30.18 
 
 
282 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  24.69 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  24.6 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  24.6 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  25.87 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  24.6 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  24.44 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  26.58 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  24.75 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  24.16 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  24.12 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  23.32 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  24.12 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  24.6 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  23.84 
 
 
367 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  24.52 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  23.73 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  30.61 
 
 
240 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  30.29 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  23.73 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0253  protein of unknown function DUF182  23.13 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0507983 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  28.39 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  34.25 
 
 
250 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  29.8 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  24.36 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  24.12 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  25.32 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  24.32 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  23.64 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  26.05 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  23.64 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  22.84 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  22.84 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2834  protein of unknown function DUF182  28.48 
 
 
253 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  30.11 
 
 
541 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  25.66 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  25.17 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  31.61 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  22.09 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  22.04 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  23.36 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  26.28 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1752  carbon monoxide dehydrogenase, coxF accessory protein  30.2 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.348042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  21.05 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>