239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0948 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  96.76 
 
 
338 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  100 
 
 
339 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  87.5 
 
 
336 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  72.16 
 
 
343 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  69.39 
 
 
682 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  69.39 
 
 
682 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  71.21 
 
 
334 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  74.16 
 
 
340 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  72.73 
 
 
336 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  73.86 
 
 
381 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  73.86 
 
 
381 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  74.16 
 
 
340 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  73.86 
 
 
381 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  73.86 
 
 
340 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  73.86 
 
 
340 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  70 
 
 
334 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  71.25 
 
 
336 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  70.61 
 
 
334 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  47.31 
 
 
330 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  51.44 
 
 
342 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  50.65 
 
 
344 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  49.34 
 
 
331 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  50.48 
 
 
344 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  40.82 
 
 
275 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  56.73 
 
 
211 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  39.76 
 
 
289 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  56.1 
 
 
220 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.49 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  57.32 
 
 
222 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  57.32 
 
 
222 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  57.32 
 
 
222 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  56.69 
 
 
220 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  56.69 
 
 
205 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  53.89 
 
 
188 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  56.21 
 
 
200 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.58 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  55.13 
 
 
196 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  37.34 
 
 
327 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  52.5 
 
 
255 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.69 
 
 
337 aa  165  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  50.3 
 
 
291 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  48.5 
 
 
276 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  35.74 
 
 
290 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  36.76 
 
 
278 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  48.5 
 
 
279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  47.9 
 
 
279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.11 
 
 
280 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  47.9 
 
 
281 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  47.31 
 
 
285 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.9 
 
 
281 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.9 
 
 
281 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  46.78 
 
 
279 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  46.71 
 
 
281 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  37.18 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.27 
 
 
278 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.64 
 
 
294 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  45.45 
 
 
280 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.45 
 
 
470 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.54 
 
 
274 aa  146  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.88 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.39 
 
 
285 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.07 
 
 
287 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  39.56 
 
 
311 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.48 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  40.62 
 
 
309 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  37.54 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  38.46 
 
 
313 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  39.53 
 
 
288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  30.48 
 
 
248 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.26 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  39.06 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  39.06 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  39.46 
 
 
313 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  38.92 
 
 
280 aa  112  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.88 
 
 
279 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  29.01 
 
 
271 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  28.05 
 
 
353 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.91 
 
 
288 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  28.49 
 
 
328 aa  102  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  42.38 
 
 
267 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  29.27 
 
 
381 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  35.98 
 
 
283 aa  92.8  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  30.14 
 
 
382 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  27.68 
 
 
351 aa  85.9  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  32.17 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  34.21 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  32.17 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.31 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.71 
 
 
271 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  27.57 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  40.14 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0253  protein of unknown function DUF182  27.12 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0507983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  49.4 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  35.95 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  24.46 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  34.12 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  46.46 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  27.86 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  29.04 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  27.87 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>