235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0257 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  100 
 
 
292 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  59.64 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  56.52 
 
 
280 aa  281  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  50.95 
 
 
279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  49.81 
 
 
283 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  40.21 
 
 
280 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.55 
 
 
279 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  40.3 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  36.1 
 
 
285 aa  178  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  38.49 
 
 
279 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.85 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  37.04 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  36.73 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.22 
 
 
288 aa  168  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  39.64 
 
 
288 aa  168  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.06 
 
 
281 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.03 
 
 
281 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.42 
 
 
294 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  35.61 
 
 
313 aa  156  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  35.58 
 
 
281 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.84 
 
 
298 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.58 
 
 
281 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.57 
 
 
274 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  41.22 
 
 
295 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  33.21 
 
 
309 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  35.27 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.51 
 
 
278 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  39.07 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  39.26 
 
 
327 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  37.7 
 
 
256 aa  132  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  38.15 
 
 
290 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.13 
 
 
268 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  40.58 
 
 
278 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.33 
 
 
285 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  32.09 
 
 
336 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  32.11 
 
 
343 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.12 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.82 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  29.43 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.35 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.83 
 
 
271 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  38.74 
 
 
247 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  31.56 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  32.35 
 
 
283 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  33.33 
 
 
271 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.82 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.21 
 
 
340 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  30.64 
 
 
340 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.64 
 
 
340 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.21 
 
 
340 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.7 
 
 
381 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.7 
 
 
381 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.7 
 
 
381 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.03 
 
 
267 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  31.2 
 
 
253 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  28.95 
 
 
279 aa  106  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  33.86 
 
 
246 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  31.13 
 
 
265 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  29.61 
 
 
330 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  28.91 
 
 
526 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.07 
 
 
196 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.18 
 
 
337 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.58 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.94 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2834  protein of unknown function DUF182  30.92 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.03 
 
 
344 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  34.81 
 
 
200 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  33.22 
 
 
320 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  34.78 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.42 
 
 
188 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.93 
 
 
470 aa  92.8  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.2 
 
 
334 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  33.76 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.77 
 
 
211 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.54 
 
 
338 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.48 
 
 
220 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  28.93 
 
 
248 aa  89  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  33.54 
 
 
339 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.21 
 
 
336 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.75 
 
 
205 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.52 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  26.62 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.62 
 
 
222 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  33.52 
 
 
682 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.62 
 
 
222 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  33.52 
 
 
682 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.62 
 
 
222 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.84 
 
 
220 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.03 
 
 
336 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  31.42 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  25.55 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  28.69 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  34.08 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  30.33 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  27.27 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.68 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  33.51 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  24.46 
 
 
541 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  24.46 
 
 
541 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  24.46 
 
 
541 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>