242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0884 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  95.81 
 
 		 334 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  95.51 
 
 		 682 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  98.5 
 
 		 334 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  668    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  95.51 
 
 		 682 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  95.05 
 
 		 336 aa  590  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  90.77 
 
 		 336 aa  587  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  73.43 
 
 		 343 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  73.73 
 
 		 340 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  74.03 
 
 		 340 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  73.73 
 
 		 340 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  74.77 
 
 		 340 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  73.73 
 
 		 381 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  73.73 
 
 		 381 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  73.73 
 
 		 381 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  69.67 
 
 		 338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  70.61 
 
 		 339 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  69.3 
 
 		 336 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  47.95 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  46.69 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  49.03 
 
 		 342 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  46.11 
 
 		 344 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  45.17 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  39.81 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  41.85 
 
 		 275 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.94 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  37.93 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  37.38 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  38.63 
 
 		 279 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.25 
 
 		 298 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.26 
 
 		 278 aa  182  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.42 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  56.33 
 
 		 222 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  56.33 
 
 		 222 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  56.33 
 
 		 222 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  54.39 
 
 		 205 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  55.76 
 
 		 211 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  39.38 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  54.43 
 
 		 220 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.35 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  53.25 
 
 		 188 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  53.25 
 
 		 200 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  53.8 
 
 		 220 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  40.65 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  53.5 
 
 		 196 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  40.4 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.81 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.32 
 
 		 268 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  34.77 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  50.61 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  37.78 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.92 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.33 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.1 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  42.94 
 
 		 276 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  45.03 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  41.76 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  44.12 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  43.48 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  44.51 
 
 		 470 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.38 
 
 		 267 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  37.42 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.43 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  38.29 
 
 		 311 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.3 
 
 		 287 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.67 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  34.98 
 
 		 283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  44.12 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  32.68 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  42.86 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  32.87 
 
 		 248 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.33 
 
 		 271 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  38.13 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  38.07 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  34.88 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  39.5 
 
 		 313 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  40.74 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  40.4 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.18 
 
 		 283 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.53 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.77 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  33.54 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  28.65 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  27.97 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  29.77 
 
 		 256 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  28.77 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.42 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  34.73 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  28.61 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  30.5 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.82 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  30.82 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  28.41 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  46.46 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  31.12 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  25.35 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  27.7 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  29.46 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  23.81 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  29.61 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>