166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3556 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  100 
 
 		 313 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  98.4 
 
 		 313 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  87.54 
 
 		 313 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  53.62 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  59.42 
 
 		 320 aa  281  8.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  46.48 
 
 		 256 aa  227  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  40.82 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  40.54 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  41.12 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.34 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.97 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  41.03 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  38.44 
 
 		 682 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  38.44 
 
 		 682 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  39.04 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  41.86 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.04 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.86 
 
 		 340 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.27 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.23 
 
 		 338 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  40.94 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.94 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.53 
 
 		 381 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.53 
 
 		 381 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.53 
 
 		 381 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  36.04 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.97 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  39.35 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.59 
 
 		 255 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  39.5 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  35.44 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  35.34 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.38 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.69 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  32.53 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.05 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  37.29 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  35.09 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.98 
 
 		 281 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.88 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.88 
 
 		 279 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  34.88 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  34.52 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.85 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  38.94 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.38 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  37.29 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.87 
 
 		 341 aa  125  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  37.71 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  40 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  34.05 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.96 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.71 
 
 		 274 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.33 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.28 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  36.15 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  34.95 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.03 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.9 
 
 		 271 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  35.05 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.99 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  28.57 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  38.01 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.3 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  31.94 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.49 
 
 		 267 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  35.66 
 
 		 247 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  33.22 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  41.1 
 
 		 220 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.47 
 
 		 205 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.49 
 
 		 220 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  42.47 
 
 		 222 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.47 
 
 		 222 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.47 
 
 		 222 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.88 
 
 		 271 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.74 
 
 		 188 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.4 
 
 		 211 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  42.28 
 
 		 470 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  38.41 
 
 		 200 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.33 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  30.77 
 
 		 248 aa  89.7  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.58 
 
 		 196 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  31.8 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  31.8 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.79 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  33.55 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.64 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  29.85 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  26.17 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  23.39 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  31.31 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.97 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  25.74 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  24.34 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  25.89 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  27.14 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  25.71 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  29.39 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  26.12 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>