209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2960 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  100 
 
 
320 aa  622  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  59.6 
 
 
311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  58.65 
 
 
313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  58.97 
 
 
313 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  57.93 
 
 
313 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  45.55 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  38.74 
 
 
330 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  39.16 
 
 
289 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.09 
 
 
294 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  37.07 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  38.82 
 
 
682 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  38.82 
 
 
682 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.71 
 
 
344 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.54 
 
 
336 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.7 
 
 
268 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  38.61 
 
 
339 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.82 
 
 
334 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  38.26 
 
 
342 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.29 
 
 
338 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  42.51 
 
 
337 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  37.43 
 
 
343 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  37.62 
 
 
327 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  37.78 
 
 
275 aa  142  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.8 
 
 
274 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.14 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.82 
 
 
344 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  34.01 
 
 
279 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  33.68 
 
 
313 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.65 
 
 
341 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  38.13 
 
 
295 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  38.02 
 
 
334 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.46 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.7 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  38.02 
 
 
336 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  39.3 
 
 
340 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.3 
 
 
340 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  38.95 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.95 
 
 
381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.95 
 
 
381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.95 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.95 
 
 
381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  33 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.76 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  39.31 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  38.44 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  29.97 
 
 
298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  32.41 
 
 
281 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  35.03 
 
 
288 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.17 
 
 
281 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.07 
 
 
281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.27 
 
 
288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  30.9 
 
 
276 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  33.23 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.81 
 
 
271 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  35.56 
 
 
280 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  31.13 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.65 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.89 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.48 
 
 
280 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  30.85 
 
 
285 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.78 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  34.1 
 
 
313 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  34.1 
 
 
313 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  29.93 
 
 
279 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  29.93 
 
 
279 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.32 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.95 
 
 
196 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.9 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  35.99 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  35.44 
 
 
247 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.03 
 
 
470 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.56 
 
 
283 aa  96.3  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.56 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.59 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  25.72 
 
 
328 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.42 
 
 
188 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  29.57 
 
 
309 aa  92.8  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  39.19 
 
 
220 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  39.19 
 
 
205 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  39.19 
 
 
222 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  39.19 
 
 
222 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.19 
 
 
222 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.51 
 
 
220 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  37.19 
 
 
286 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.81 
 
 
292 aa  89  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.58 
 
 
211 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  35.58 
 
 
200 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  30.3 
 
 
248 aa  85.9  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  26.1 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  29.97 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  26.46 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2834  protein of unknown function DUF182  35.37 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  29.85 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  28.57 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  27.62 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  24.5 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  33.22 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  33.01 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  25.55 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  26.23 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>