More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1020 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  99.41 
 
 
341 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  99.7 
 
 
334 aa  670    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  95.81 
 
 
334 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  100 
 
 
341 aa  691    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  100 
 
 
682 aa  1382    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  93.55 
 
 
341 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  93.84 
 
 
341 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  100 
 
 
682 aa  1382    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  94.13 
 
 
341 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  95.51 
 
 
334 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  97.02 
 
 
336 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  84.75 
 
 
341 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  91.64 
 
 
336 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  84.16 
 
 
341 aa  588  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  84.16 
 
 
341 aa  588  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  83.87 
 
 
341 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  83.87 
 
 
341 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  83.87 
 
 
341 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  83.87 
 
 
341 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  84.08 
 
 
350 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  83.87 
 
 
341 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  81.74 
 
 
346 aa  582  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  83.78 
 
 
350 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  74.33 
 
 
343 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  74.63 
 
 
340 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  74.63 
 
 
381 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  74.63 
 
 
381 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  74.63 
 
 
381 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  74.63 
 
 
340 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  74.33 
 
 
340 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  69.39 
 
 
339 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  73.51 
 
 
340 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  70.61 
 
 
338 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  69.49 
 
 
336 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  67.35 
 
 
345 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  66.67 
 
 
345 aa  458  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  67.06 
 
 
345 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  67.76 
 
 
351 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  66.87 
 
 
354 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  63.06 
 
 
365 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  69.21 
 
 
357 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  67.59 
 
 
346 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  65.66 
 
 
360 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  68.1 
 
 
350 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  67.51 
 
 
356 aa  429  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  65.75 
 
 
349 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  62.29 
 
 
375 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  64.55 
 
 
341 aa  421  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  64.92 
 
 
343 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  65.48 
 
 
350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  61.59 
 
 
335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  56.06 
 
 
332 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  59.76 
 
 
349 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  61.14 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  60.37 
 
 
345 aa  399  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  59.25 
 
 
317 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  59.94 
 
 
316 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  59.29 
 
 
316 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  59.49 
 
 
315 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  58.36 
 
 
339 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  58.36 
 
 
315 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  58.13 
 
 
318 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  58.31 
 
 
317 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  58.99 
 
 
315 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  59.47 
 
 
334 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  61.69 
 
 
315 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  58.54 
 
 
337 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  56.36 
 
 
339 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  56.13 
 
 
335 aa  385  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  56.17 
 
 
328 aa  383  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  57.37 
 
 
317 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  59.24 
 
 
315 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  57.85 
 
 
338 aa  382  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  57.58 
 
 
361 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  53.52 
 
 
335 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  53.61 
 
 
335 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  53.64 
 
 
336 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  55.62 
 
 
338 aa  361  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  54.01 
 
 
335 aa  359  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  55.42 
 
 
343 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  54.24 
 
 
339 aa  356  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  51.21 
 
 
330 aa  353  8e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  53.97 
 
 
336 aa  350  4e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  53.99 
 
 
329 aa  345  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  53.92 
 
 
347 aa  340  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  53.92 
 
 
347 aa  340  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  50.62 
 
 
341 aa  334  3e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  50 
 
 
378 aa  334  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  52.9 
 
 
338 aa  327  3e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  51.59 
 
 
341 aa  328  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  48.77 
 
 
343 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  54.04 
 
 
328 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  50.46 
 
 
353 aa  318  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  47.32 
 
 
341 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  49.4 
 
 
333 aa  314  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  49.12 
 
 
342 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2390  adenosine deaminase  45.24 
 
 
346 aa  301  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  47.26 
 
 
344 aa  300  7e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  44.28 
 
 
337 aa  299  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0809  adenosine deaminase  44.12 
 
 
338 aa  297  4e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>