218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0497 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  100 
 
 		 311 aa  623  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  59.57 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  54.79 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  53.29 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  53.29 
 
 		 313 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  43.88 
 
 		 256 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  37.54 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.87 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.68 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.18 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  39.56 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  37.97 
 
 		 682 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  37.97 
 
 		 682 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.97 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  37.54 
 
 		 330 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  37.14 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  36.89 
 
 		 342 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.8 
 
 		 344 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.66 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  37.46 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  33.76 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.73 
 
 		 336 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.92 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  37.66 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  39.33 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  38.89 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.89 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  33.92 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  35.56 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.81 
 
 		 381 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.81 
 
 		 381 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.81 
 
 		 381 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  38.54 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.54 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  35.14 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  33.89 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.57 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.33 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.75 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  37.54 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  37.34 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  34.97 
 
 		 291 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.22 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.27 
 
 		 341 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  35.59 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  39.86 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.22 
 
 		 255 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.21 
 
 		 279 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.14 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.91 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  32.87 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  36.45 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.3 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  32.52 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.36 
 
 		 337 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.77 
 
 		 196 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  34.6 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  34.6 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.04 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  30.84 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.41 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  39.33 
 
 		 200 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.02 
 
 		 220 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  31.72 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  31.21 
 
 		 288 aa  108  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.33 
 
 		 188 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.17 
 
 		 220 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.13 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40 
 
 		 205 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40 
 
 		 222 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40 
 
 		 222 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40 
 
 		 222 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.56 
 
 		 211 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.11 
 
 		 470 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.56 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.68 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  33.89 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.44 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.91 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  36.33 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.87 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  27.04 
 
 		 328 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  33.92 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.85 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.97 
 
 		 271 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.23 
 
 		 364 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.63 
 
 		 292 aa  85.9  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  24.75 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  26.85 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  39.35 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  29.43 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  25 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  30.74 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  28.61 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  29.75 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  32.05 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  26.49 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  26.12 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  28.97 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  23.14 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>