272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02517 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  100 
 
 		 313 aa  647    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  50.67 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  47.69 
 
 		 285 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  48.58 
 
 		 276 aa  255  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  49.19 
 
 		 281 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  48.99 
 
 		 279 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  48.58 
 
 		 291 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.79 
 
 		 281 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.79 
 
 		 281 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.58 
 
 		 281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  45.75 
 
 		 280 aa  242  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  44.03 
 
 		 279 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  44.4 
 
 		 279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  46.56 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  42.86 
 
 		 298 aa  225  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.64 
 
 		 288 aa  215  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  42.2 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  35.02 
 
 		 328 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  41.47 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  34.39 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  38.91 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.56 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.13 
 
 		 278 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  39.62 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.33 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.98 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  33.22 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.94 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  38.28 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  32.48 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.16 
 
 		 279 aa  158  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  39.84 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.84 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.17 
 
 		 285 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.29 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  33.76 
 
 		 256 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.4 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  36.14 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.99 
 
 		 344 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  35.89 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  39.68 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  36.23 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.22 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.46 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  38.84 
 
 		 247 aa  135  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.6 
 
 		 271 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.87 
 
 		 470 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.32 
 
 		 267 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.04 
 
 		 211 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.13 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  37.13 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.19 
 
 		 222 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.19 
 
 		 222 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  36.36 
 
 		 205 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.19 
 
 		 222 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  30.29 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.81 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  33.06 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  34.11 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  33.69 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.11 
 
 		 188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  36.11 
 
 		 200 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  35.19 
 
 		 248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  39.46 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.82 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.97 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  32.75 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  32.97 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.67 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  30.18 
 
 		 286 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  31 
 
 		 526 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  32.97 
 
 		 343 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  32.01 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.5 
 
 		 337 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.58 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.15 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  32.01 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  29.14 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  35.15 
 
 		 682 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  35.15 
 
 		 682 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  31.58 
 
 		 279 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.54 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  28.02 
 
 		 265 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  28.69 
 
 		 265 aa  97.1  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.15 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  32.48 
 
 		 263 aa  97.1  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  34.76 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  32.92 
 
 		 282 aa  95.9  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  34.23 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.23 
 
 		 381 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.23 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.23 
 
 		 381 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.23 
 
 		 381 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  33.56 
 
 		 340 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  29.96 
 
 		 541 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  29.96 
 
 		 541 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  29.96 
 
 		 541 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.96 
 
 		 541 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.96 
 
 		 541 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  29.96 
 
 		 541 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>