248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4866 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  100 
 
 
298 aa  624  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  50.97 
 
 
276 aa  285  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  51.38 
 
 
281 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  45.35 
 
 
280 aa  275  8e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  45.3 
 
 
291 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  50.99 
 
 
281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  48.51 
 
 
285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  46.82 
 
 
279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  47.76 
 
 
279 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  50.59 
 
 
281 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  46.44 
 
 
279 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  49.01 
 
 
281 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  43.33 
 
 
309 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.82 
 
 
255 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  42.15 
 
 
288 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  42.86 
 
 
313 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.37 
 
 
288 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.97 
 
 
278 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  34.23 
 
 
343 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  36.94 
 
 
328 aa  189  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  34.29 
 
 
682 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  34.29 
 
 
682 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.56 
 
 
334 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  35.43 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.25 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  33.12 
 
 
330 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  35.09 
 
 
280 aa  178  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.73 
 
 
336 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  33.64 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  33.67 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  33.66 
 
 
342 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  38.74 
 
 
290 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.12 
 
 
344 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  33.73 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  34.7 
 
 
289 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.02 
 
 
294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.72 
 
 
283 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.99 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  35.71 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.82 
 
 
280 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  35.2 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.98 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.6 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  34.12 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.6 
 
 
285 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  34.89 
 
 
256 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.88 
 
 
338 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.7 
 
 
287 aa  143  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  39.88 
 
 
339 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  31.65 
 
 
286 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.51 
 
 
196 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.13 
 
 
267 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.68 
 
 
292 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.24 
 
 
336 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.87 
 
 
188 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  38.99 
 
 
200 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  34.07 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.29 
 
 
220 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40.65 
 
 
220 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.67 
 
 
211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.24 
 
 
205 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40.94 
 
 
222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.94 
 
 
222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40.94 
 
 
222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.65 
 
 
470 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.73 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  38.8 
 
 
340 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.8 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.8 
 
 
340 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.8 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.8 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.99 
 
 
344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  34.76 
 
 
248 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  38.25 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.99 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  34.6 
 
 
247 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.28 
 
 
271 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.27 
 
 
267 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  30.14 
 
 
311 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.58 
 
 
341 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  30.89 
 
 
271 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  30.19 
 
 
263 aa  109  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.58 
 
 
337 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  28.92 
 
 
526 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  31.21 
 
 
320 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  29.53 
 
 
265 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  32.26 
 
 
282 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  27.91 
 
 
246 aa  99  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  29.66 
 
 
313 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  29.93 
 
 
313 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  25.29 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  27.63 
 
 
253 aa  92.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  29.93 
 
 
313 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  30.12 
 
 
541 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  30.12 
 
 
541 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  30.12 
 
 
541 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  30.12 
 
 
541 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  30.12 
 
 
541 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  30.12 
 
 
541 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  30.12 
 
 
541 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>