More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0202 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  38.75 
 
 		 265 aa  184  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  42.13 
 
 		 263 aa  164  9e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  38 
 
 		 541 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  38 
 
 		 541 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  38 
 
 		 541 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  38 
 
 		 541 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  38 
 
 		 541 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  38 
 
 		 541 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  38 
 
 		 541 aa  158  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.6 
 
 		 541 aa  158  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  40.49 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.55 
 
 		 249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  38.43 
 
 		 526 aa  149  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  36.33 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  34.47 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  33.76 
 
 		 398 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.68 
 
 		 353 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  39.81 
 
 		 362 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  31.1 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  37 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  27.8 
 
 		 265 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.67 
 
 		 354 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  34.16 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  36.67 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  43.9 
 
 		 341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  43.42 
 
 		 376 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  30.93 
 
 		 384 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  36.99 
 
 		 279 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  35.14 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  33.22 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  35.14 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.77 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  33.06 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  40.85 
 
 		 354 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1569  hypothetical protein  37.6 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  35.14 
 
 		 306 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  38.22 
 
 		 375 aa  118  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  32.94 
 
 		 285 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.25 
 
 		 255 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  33.06 
 
 		 281 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  38.25 
 
 		 344 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  33.59 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  33.98 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  28.33 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.66 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.66 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.74 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  28.81 
 
 		 367 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  32.16 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  32.94 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2092  hypothetical protein  34.5 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  30.99 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  31.75 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.2 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  37.5 
 
 		 382 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  29.55 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  34.6 
 
 		 351 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.74 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2834  protein of unknown function DUF182  36.18 
 
 		 253 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  28.09 
 
 		 386 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  27.62 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  35.06 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  31.56 
 
 		 369 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1752  carbon monoxide dehydrogenase, coxF accessory protein  36.47 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  33.47 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  33.47 
 
 		 386 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  33.47 
 
 		 386 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  31.67 
 
 		 368 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  29.02 
 
 		 453 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  34.78 
 
 		 425 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  34.76 
 
 		 372 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  36.55 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  32.46 
 
 		 275 aa  99.4  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  31.54 
 
 		 289 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  29.25 
 
 		 339 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  30.83 
 
 		 380 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  27.91 
 
 		 298 aa  99  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  27.46 
 
 		 340 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  31.78 
 
 		 366 aa  98.6  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  31.62 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  33.47 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  26.67 
 
 		 340 aa  98.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  31.54 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  30.16 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  33.47 
 
 		 368 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  29.08 
 
 		 315 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  32.07 
 
 		 386 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  28.72 
 
 		 338 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  29.31 
 
 		 385 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  29.69 
 
 		 288 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  32.26 
 
 		 397 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  27.12 
 
 		 340 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.72 
 
 		 341 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  32.55 
 
 		 288 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1215  protein of unknown function DUF182  35.77 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516897  normal  0.921927 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  26.67 
 
 		 345 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.72 
 
 		 341 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  31.37 
 
 		 327 aa  96.3  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>