247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2427 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  100 
 
 
330 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  83.73 
 
 
331 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  61.88 
 
 
342 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  57.86 
 
 
344 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  58.33 
 
 
344 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.27 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  47.31 
 
 
339 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  48.9 
 
 
682 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  48.9 
 
 
682 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.59 
 
 
336 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48 
 
 
334 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  46.59 
 
 
343 aa  275  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.32 
 
 
334 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.1 
 
 
336 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  48.9 
 
 
336 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  47.47 
 
 
334 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  47.08 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  47.53 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.08 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.08 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.84 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.08 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.08 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  43.24 
 
 
279 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  42.57 
 
 
279 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  43.27 
 
 
275 aa  222  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  63.8 
 
 
200 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  65 
 
 
196 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  68.39 
 
 
211 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  63.8 
 
 
188 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.82 
 
 
281 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  65.38 
 
 
220 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  67.11 
 
 
220 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  66.03 
 
 
205 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  66.03 
 
 
222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  66.03 
 
 
222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  66.03 
 
 
222 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  38.61 
 
 
285 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.72 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  42.76 
 
 
279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  40.52 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.38 
 
 
278 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.73 
 
 
255 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  40.69 
 
 
281 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  42.24 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  38.22 
 
 
280 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.57 
 
 
294 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.28 
 
 
281 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  40.13 
 
 
327 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.99 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.67 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  40.33 
 
 
295 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.12 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.69 
 
 
268 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  34.39 
 
 
313 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  39.73 
 
 
290 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.54 
 
 
285 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.35 
 
 
470 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.34 
 
 
287 aa  165  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  32.33 
 
 
309 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  34.75 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.54 
 
 
267 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  34.7 
 
 
288 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.46 
 
 
280 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  34.07 
 
 
276 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  36.54 
 
 
271 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  36.91 
 
 
278 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.96 
 
 
337 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  34.75 
 
 
256 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.76 
 
 
271 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.05 
 
 
267 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.33 
 
 
283 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.46 
 
 
271 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  39.36 
 
 
320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  40.07 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  36.88 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  32.78 
 
 
280 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  35.21 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  40.77 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.33 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  40.42 
 
 
313 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  33.33 
 
 
248 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.33 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  31.38 
 
 
286 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.82 
 
 
364 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  32.19 
 
 
313 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  32.19 
 
 
313 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  27.37 
 
 
328 aa  99  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  28.39 
 
 
246 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  27.41 
 
 
346 aa  89.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  28.32 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  27.74 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  29.18 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  28.49 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  26.09 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0253  protein of unknown function DUF182  26.16 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0507983 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  25.29 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  27.99 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  25.95 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  25.9 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>