134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0351 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  100 
 
 
248 aa  507  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  98.79 
 
 
267 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  76.59 
 
 
280 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  62.9 
 
 
285 aa  310  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  51.61 
 
 
271 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  51.21 
 
 
271 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  50.4 
 
 
271 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  50.4 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  47.37 
 
 
283 aa  209  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  46.72 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  43.55 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.55 
 
 
278 aa  138  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  34.78 
 
 
682 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  34.78 
 
 
682 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.11 
 
 
334 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.11 
 
 
334 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.69 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  35.97 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.92 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  35.92 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  37.14 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.68 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  31.25 
 
 
331 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.33 
 
 
255 aa  131  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  33.33 
 
 
330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  35.51 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.96 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  36.59 
 
 
285 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.1 
 
 
281 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.33 
 
 
336 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.58 
 
 
294 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  33.78 
 
 
334 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  37.14 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.18 
 
 
281 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  31.8 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.78 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.1 
 
 
344 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  32.11 
 
 
343 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  35.19 
 
 
289 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.38 
 
 
344 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  34.29 
 
 
309 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  35.92 
 
 
291 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  31.03 
 
 
342 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  35.37 
 
 
280 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  35.25 
 
 
327 aa  121  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.57 
 
 
268 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  34.69 
 
 
313 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.06 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  32.28 
 
 
280 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  33.11 
 
 
336 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.94 
 
 
274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  34.94 
 
 
295 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  30.5 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.5 
 
 
381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.5 
 
 
381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.5 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.5 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.5 
 
 
381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.5 
 
 
340 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  34.31 
 
 
290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.79 
 
 
205 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.79 
 
 
222 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.79 
 
 
222 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.79 
 
 
222 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.79 
 
 
220 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.18 
 
 
220 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  29.11 
 
 
341 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.65 
 
 
211 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.04 
 
 
188 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  31.75 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  31.82 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  28.86 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  31.3 
 
 
256 aa  95.9  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  36.81 
 
 
200 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  30.95 
 
 
278 aa  95.5  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.81 
 
 
470 aa  93.2  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.97 
 
 
196 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  29.55 
 
 
286 aa  88.6  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  27.87 
 
 
337 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.67 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  25.77 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  28.73 
 
 
320 aa  75.1  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  27.66 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  29.22 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  27.23 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  28.28 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  29.44 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  27.69 
 
 
313 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  29.44 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  30.49 
 
 
345 aa  60.5  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  28.51 
 
 
526 aa  58.9  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2834  protein of unknown function DUF182  26.42 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  28.14 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  29.52 
 
 
353 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  27.44 
 
 
354 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  27.94 
 
 
346 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0253  protein of unknown function DUF182  23.13 
 
 
337 aa  56.2  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0507983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  27.98 
 
 
282 aa  53.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  29.59 
 
 
344 aa  53.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>