171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2420 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  82.25 
 
 
188 aa  291  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  81.07 
 
 
200 aa  289  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  77.98 
 
 
211 aa  267  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  77.91 
 
 
220 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  71.2 
 
 
220 aa  265  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  77.3 
 
 
205 aa  262  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  77.3 
 
 
222 aa  262  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  77.3 
 
 
222 aa  262  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  77.3 
 
 
222 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  63.47 
 
 
331 aa  224  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  64.71 
 
 
344 aa  224  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  62.01 
 
 
344 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  67.1 
 
 
342 aa  222  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  65 
 
 
330 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  59.24 
 
 
343 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  57.69 
 
 
336 aa  174  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  55.13 
 
 
339 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  54.72 
 
 
338 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  54.78 
 
 
334 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  54.78 
 
 
682 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  54.78 
 
 
682 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  52.6 
 
 
470 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  53.5 
 
 
334 aa  168  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  56.05 
 
 
336 aa  168  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  58.45 
 
 
340 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  58.45 
 
 
340 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  50.64 
 
 
255 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  58.45 
 
 
381 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  58.45 
 
 
381 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  59.86 
 
 
340 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  58.45 
 
 
381 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  59.15 
 
 
340 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  53.5 
 
 
334 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  50.68 
 
 
280 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  50 
 
 
279 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  46.99 
 
 
285 aa  161  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  50 
 
 
279 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  44.58 
 
 
276 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  48.65 
 
 
279 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.59 
 
 
281 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  48.65 
 
 
291 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.92 
 
 
281 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  54.78 
 
 
336 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  46.9 
 
 
281 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  46.9 
 
 
281 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  46.75 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.51 
 
 
298 aa  141  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.41 
 
 
294 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  46.41 
 
 
278 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  45.39 
 
 
290 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  45.64 
 
 
289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  44.23 
 
 
288 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.61 
 
 
341 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  39.61 
 
 
309 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  44 
 
 
327 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  36.81 
 
 
313 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  43.04 
 
 
295 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  44 
 
 
274 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  41.77 
 
 
311 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  44.97 
 
 
268 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  44.3 
 
 
278 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  44.22 
 
 
285 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  45.58 
 
 
280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.91 
 
 
288 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.07 
 
 
283 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  43.06 
 
 
283 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.87 
 
 
279 aa  108  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  43.92 
 
 
337 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  38.96 
 
 
280 aa  105  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  41.1 
 
 
271 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.62 
 
 
271 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.77 
 
 
287 aa  99.8  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.76 
 
 
271 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.78 
 
 
267 aa  96.3  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  36.42 
 
 
286 aa  95.1  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  32.47 
 
 
328 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  36.13 
 
 
320 aa  94  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  40.96 
 
 
247 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  36.91 
 
 
313 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  37.58 
 
 
313 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  37.58 
 
 
313 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  34.48 
 
 
256 aa  88.6  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  40 
 
 
313 aa  88.6  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  40 
 
 
313 aa  88.6  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  36.6 
 
 
248 aa  84.7  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.25 
 
 
267 aa  84.3  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.13 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  34.44 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32 
 
 
364 aa  72  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  27.17 
 
 
351 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  29.33 
 
 
345 aa  67.8  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  32.03 
 
 
354 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  27.44 
 
 
265 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  29.22 
 
 
341 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  29.03 
 
 
375 aa  62  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  31.9 
 
 
376 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  27.81 
 
 
265 aa  61.6  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  29.87 
 
 
384 aa  61.2  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  30.06 
 
 
346 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>