155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1638 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  100 
 
 
286 aa  554  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  59.64 
 
 
292 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  53.85 
 
 
280 aa  261  8.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.91 
 
 
279 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  44.89 
 
 
283 aa  209  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  39.08 
 
 
288 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.65 
 
 
298 aa  142  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  36.73 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.03 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.52 
 
 
288 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  34.06 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  32.85 
 
 
291 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.48 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  32.97 
 
 
285 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  34.48 
 
 
279 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  34.07 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.43 
 
 
274 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  39.93 
 
 
295 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  36.57 
 
 
256 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.94 
 
 
281 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.31 
 
 
281 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  34.31 
 
 
281 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  30.29 
 
 
313 aa  122  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.54 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  37.5 
 
 
290 aa  119  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.19 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.38 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  34.43 
 
 
275 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.43 
 
 
285 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.23 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  31.9 
 
 
331 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.27 
 
 
280 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.9 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  36.4 
 
 
327 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  35.25 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.35 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  27.55 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  31.38 
 
 
330 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  35.96 
 
 
247 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  29.12 
 
 
309 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.15 
 
 
278 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  37.32 
 
 
278 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  31.46 
 
 
283 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  31.85 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.26 
 
 
267 aa  96.3  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.42 
 
 
196 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.16 
 
 
211 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  28.43 
 
 
342 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  29.52 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.42 
 
 
220 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.99 
 
 
470 aa  90.1  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.76 
 
 
220 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  36.84 
 
 
222 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  36.84 
 
 
222 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.84 
 
 
222 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  36.84 
 
 
205 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  27.94 
 
 
253 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  32.07 
 
 
200 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.03 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  37.22 
 
 
343 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.54 
 
 
188 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.71 
 
 
341 aa  85.9  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  34.21 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.48 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  37.19 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.53 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  29.31 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  25.93 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2834  protein of unknown function DUF182  28.68 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.96 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.18 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  39.35 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.89 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  34.16 
 
 
682 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  34.16 
 
 
682 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.71 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  25.44 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  38.12 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  39.75 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.21 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  31.25 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  34.17 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  39.13 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  34.73 
 
 
334 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  25.09 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  23.64 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  28.24 
 
 
526 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.77 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  35.77 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  37.68 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.68 
 
 
381 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.68 
 
 
381 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.68 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.68 
 
 
381 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  28.11 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  29.89 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  26.44 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  25 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  34.9 
 
 
313 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  34.9 
 
 
313 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>