More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2834 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2834  protein of unknown function DUF182  100 
 
 		 253 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  73.91 
 
 		 253 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  35.48 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  31.6 
 
 		 526 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  33.05 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  31.94 
 
 		 265 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  36.18 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  29.03 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  33.85 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  32.05 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.43 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.05 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  32.05 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  31.78 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  31.01 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  30.98 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.46 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.62 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  32.66 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  34.87 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  31.91 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  29.81 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  30.74 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.27 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.17 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.7 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  30.35 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  31.4 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  29.84 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  32.2 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.58 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  30 
 
 		 249 aa  99  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  33.45 
 
 		 289 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  33.61 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  25.53 
 
 		 541 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  31.55 
 
 		 345 aa  93.2  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  29.04 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  25.11 
 
 		 541 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  25.11 
 
 		 541 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  25.11 
 
 		 541 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  25.11 
 
 		 541 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  25.11 
 
 		 541 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  25.11 
 
 		 541 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  25.11 
 
 		 541 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.03 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  32.55 
 
 		 278 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  32.95 
 
 		 341 aa  89.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  26.95 
 
 		 298 aa  89  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.8 
 
 		 292 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1569  hypothetical protein  28.98 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  32.18 
 
 		 372 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  27.9 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  27.46 
 
 		 367 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  27.27 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  31.68 
 
 		 271 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.67 
 
 		 353 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  28.52 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  28.26 
 
 		 306 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  28.26 
 
 		 306 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  33.99 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  28.27 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  27.94 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  34.25 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  25.41 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  33.78 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  29.81 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  25.41 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0029  hypothetical protein  25.4 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  32.28 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.48 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.72 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.51 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  28.4 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  27.65 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  30.49 
 
 		 365 aa  82  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  31.74 
 
 		 362 aa  82  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  25.17 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.77 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  29.52 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  30.92 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  29.84 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  28.7 
 
 		 375 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  30.54 
 
 		 382 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  25.74 
 
 		 339 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  28.27 
 
 		 398 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  27.92 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  25.84 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.65 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  25.57 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  27.92 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  25.85 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  25.57 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  30.62 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  25.41 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  25.41 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  32.24 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.63 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1376  hypothetical protein  26.01 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.403864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  27.17 
 
 		 389 aa  75.5  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>