More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0635 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  100 
 
 
362 aa  705    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  42.66 
 
 
346 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  41.43 
 
 
341 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.92 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  39.47 
 
 
354 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  40.41 
 
 
351 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.26 
 
 
353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  39.19 
 
 
344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  38.52 
 
 
376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  36.08 
 
 
345 aa  190  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  36.44 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  34.64 
 
 
375 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  38.64 
 
 
382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  46.89 
 
 
249 aa  165  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  36.44 
 
 
376 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  44.5 
 
 
281 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  37.12 
 
 
307 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  35.85 
 
 
381 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  35.14 
 
 
397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  34.41 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  33.88 
 
 
368 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  33.98 
 
 
366 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  32.48 
 
 
356 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  45.96 
 
 
384 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  34.19 
 
 
373 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  34.2 
 
 
342 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  27.78 
 
 
367 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  31.94 
 
 
357 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  32.88 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  32.88 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  30.03 
 
 
379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  32.61 
 
 
386 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  39.81 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  35.51 
 
 
323 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  33.52 
 
 
385 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  33.43 
 
 
329 aa  133  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  35.06 
 
 
385 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  37.57 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  34.21 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  30.95 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  42.26 
 
 
282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  32.05 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  43.48 
 
 
286 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  33.53 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  31.92 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  31.83 
 
 
318 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  31.64 
 
 
374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  29.25 
 
 
388 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  32.54 
 
 
345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  42.53 
 
 
374 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  30.25 
 
 
400 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.95 
 
 
269 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  31.44 
 
 
363 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  32.21 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  31.87 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  31.71 
 
 
385 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  37.93 
 
 
277 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  32.56 
 
 
372 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  31.4 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  31.69 
 
 
402 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  31.42 
 
 
340 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  28.15 
 
 
382 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  31.87 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  31.62 
 
 
398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  33.05 
 
 
370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  31.2 
 
 
372 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  30.34 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  29.85 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  31.53 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  28.32 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  33.52 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  32.36 
 
 
421 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  30.18 
 
 
389 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  36.79 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  28.61 
 
 
395 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  31.67 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  32.25 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  30.21 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  31.34 
 
 
331 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  32.67 
 
 
312 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  25.65 
 
 
386 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  30.47 
 
 
343 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  30.47 
 
 
343 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  43.14 
 
 
425 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  29.05 
 
 
341 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  31.22 
 
 
433 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  33.15 
 
 
265 aa  105  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  32.54 
 
 
356 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  41.22 
 
 
306 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04230  hypothetical protein  35.94 
 
 
328 aa  104  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.65 
 
 
364 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  38.61 
 
 
225 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  30.86 
 
 
337 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  37.13 
 
 
248 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  30.75 
 
 
334 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  30.79 
 
 
341 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  37.42 
 
 
244 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  39.02 
 
 
306 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  28.41 
 
 
332 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  29.65 
 
 
453 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>